細胞応答のデュアル検出システム及び方法

专利摘要:
本発明のシステム及び方法は、光学バイオセンサにおけるエバネッセント波無標識光及びエバネッセント波励起蛍光標識発光のデュアル検出のためのものである。
公开号:JP2011514963A
申请号:JP2010528001
申请日:2008-10-03
公开日:2011-05-12
发明作者:チー ウー；イェ ファン；アン；エム． フェリエ；ディープティ；ジェー． ムダリア；ジョイディープ ラヒリ
申请人:コーニング インコーポレイテッド；
IPC主号:G01N21-64

专利说明:

[0001] 本発明は生細胞の刺激誘発応答を検出するための光学バイオセンサに係り、特に、共振（共鳴）導波路グレーティング（ＲＷＧ：resonant waveguide grating）バイオセンサに関する。]
[0002] 本発明は、例えば、刺激に応答して生成される生細胞のエバネッセント波（ＥＷ：evanescent wave）励起蛍光発光及びエバネッセント波ベース（に基づいた）ダイナミックマスリディストリビューション（ＤＭＲ：dynamic mass redistribution）シグナルを検出することができるデュアルモードもしくはマルチモードのシステム及び方法を提供する。実施例で本発明は、選択されたターゲットについての細胞シグナリング（cell-signaling）、コンパウンドスクリーニング等の研究を可能にする方法を教示する（高スループットフォーマットの場合もある）。このシステム及び方法はシグナリングの特殊性（特異性）と高度な情報内容を提供する。実施例で本発明はデュアルモードもしくはマルチモードのイオンチャネルバイオセンサ細胞アッセイのためのシステム及び方法を教示する。さらに、本発明は、長励起波長（例えば、約６５０ｎｍより長い波長）のエバネッセント波励起蛍光発光を使用して細胞反応の検出を可能にする技術を開示する。ここに開示されたシステム及び方法は色々な用途で使用することができる。例えば、本発明のシステム及び方法は、創薬、治療効果評価（例えば、ＡＤＭＥ−Ｔｏｘ（absorption（吸収）、distribution（分布）、metabolism（代謝）、excretion（排泄）及びtoxicity（毒性））の研究）、診断、環境痕跡分析（environmental trace analysis：環境トレース分析）、バイオテロリズム検出、基礎研究及び応用研究その他に使用することができる。]
図面の簡単な説明

[0003] 図１は、本発明の実施例において、固定化生細胞のセンシングボリューム内における細胞物質のダイナミック再配置（リディストリビューション）の結果として、エバネッセント波励起蛍光及びエバネッセント波光信号（即ち、ＤＭＲ信号）の双方を同時に検出することができる共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）バイオセンサの概略を示す図である。
図２Ａ−２Ｃは本発明の実施例において、刺激（物質）に応じて生細胞の標識非依存（ラベル非依存）光信号と標識依存光信号とを生成するバイオセンサシステムの概略を示す図である。
図３Ａ−３Ｂは本発明の実施例において、ＴＭモード（transverse magnetic mode：横磁場モード）を使用した場合の共鳴波長と入射角の相関関係を示す図である。
図４Ａ−４Ｂは本発明の実施例において、ＴＥモード（transverse electric mode：横電場（磁界）モード）を使用した場合の共鳴波長と入射角の相関関係を示す図である。
図５は本発明の実施例において、入射角が右から左に１度から５７度へ１度ずつ増加した場合のＴＭモード（横磁場モード）のグレーティング反射スペクトラを示す図である。
図６Ａ−６Ｂは本発明の実施例において、（比較的）短い波長の光が２次回折を介してグレーティング（格子）に共鳴結合され得ることを示す図である。
図７Ａ−７Ｂは本発明の実施例におけるマイクロプレートアレイフォーマットのＲＷＧバイオセンサの概略を示すと共に、共鳴周波数７８５ｎｍでフォワード（forward）伝播ＴＭモードを使用した場合の２つの別々の領域（基準領域とサンプル領域）を有するバイオセンサウエル（well）の蛍光発光イメージを示す図である。
図８は本発明の実施例において、図７Ｂのセンサのスキャンされた行（scanned row：走査行）の蛍光発光強度分布を示す図である。
図９Ａ−９Ｂは本発明の実施例において、共鳴周波数７８５ｎｍのフォワード伝播ＴＥモードを使用した場合の２つの別々の領域を有するバイオセンサウエルの蛍光発光イメージを示し、図９Ａの選択（selected）画素範囲におけるバイオセンサのスキャンされた蛍光発光強度を示す図である。
図１０Ａ−１０Ｂは本発明の実施例において、共鳴周波数７９０ｎｍのフォワード伝播ＴＭモードを使用した場合の２つの別々の領域を有するバイオセンサウエルの蛍光発光イメージを示し、選択画素範囲におけるバイオセンサのスキャンされた蛍光発光強度分布を示す図である。
図１１Ａ−１１Ｂは本発明の実施例において、共鳴周波数７９０ｎｍのフォワード伝播ＴＭモードを使用した場合の２つの別々の領域を有するバイオセンサウエルの蛍光発光イメージを示し、選択画素範囲におけるバイオセンサの蛍光発光強度分布を示す図である。
図１２Ａ−１２Ｄは本発明の実施例において、ＩＲＤｙｅ（米国登録商標）標識化ＥＧＦによる刺激（物質）に応答して、バイオセンサマイクロプレート表面に培養されたＡ４３１細胞の蛍光発光強度がどのように径時変化するかを比較するための図である。
図１３Ａ−１３Ｃは本発明の実施例において、基底細胞膜表面において可視領域内で膜（メンブラン）電位感応色素を励起するバイオセンサシステムの概略を示す図である。
図１４Ａ−１４Ｃは本発明の実施例において、１つの色素が膜電位感応色素であり且つ基底細胞膜表面にある場合、可視領域内で２つの蛍光発光色素を励起するバイオセンサシステムの概略を示す図である。
図１５Ａ−１５Ｃは本発明の実施例において、基底細胞膜表面に蛍光発光クエンチャ（消光剤）が存在する場合、可視領域内で膜電位感応色素を励起するバイオセンサシステムの概略を示す図である。] 図１ 図２Ａ 図５ 図７Ａ 図７Ｂ 図８
実施例

[0004] 以下において本発明の色々な実施例を添付図面に基づいて詳細に説明する。複数の実施例について説明をするが、当該実施例によって本発明の範囲が限定されるものではない。本発明の範囲は特許請求の範囲の記載によってのみ限定される。また、本明細書に記載された実施例・（事）例は制限的な意味を持たず、単にクレーム発明の多くの実施可能な実施形態の幾つかを示しているだけである。]
[0005] 用語の定義
「アッセイ（試験、測定、検定、分析）」及び「アッセイ法（試験法、測定法、検定法、分析法）」等は、例えば、刺激物（質）との接触もしくは刺激物（質）による刺激に応答して生ずる細胞の標識（ラベル）依存反応及び標識非依存反応についての存在、不存在、量、範囲、程度、広がり、限度、動態（速度、運動量、反応速度等）、タイプ、種類その他の測定値を判定・決定するための解析・分析を意味する。当該刺激物は、例えば、外因性もしくは内因性の刺激物（例えば、坑体、坑体ミミック、リガンド候補物質、ウイルス粒子、病原体、病原菌等）である。]
[0006] 「付着・接着」、「付着（接着）物」、「付着（接着）する」、「付着した」、「付けられた」、「付着（吸着）性の」、「付着（吸着、接着）力がある」、「固定（化）」等の用語は、概して、例えば下記の物を所定の表面に固定することもしくは不動にすることを意味する。下記の物は例えば、表面改質物質、コンパティビライザ（compatibilizer：適合化物質）、細胞、リガンド候補物質等の物質であり、付着は例えば、物理的な吸着、化学的な結合その他のプロセスまたはこれらの組み合わせにより行われる。特に「細胞付着」、「細胞接着」等の表現は表面に対する細胞の相互作用、結合、接合を意味する。当該相互作用、結合等は例えば、培養または細胞アンカリング物質（例えば、細胞外マトリックス、アドヒージョンコンプレックス（adhesion complexes：接着複合体））、コンパティビライザ（例えば、フィブロネクチン、コラーゲン、ラミン、ゼラチン、ポリリジン）等の物質もしくはこれらの組み合わせとの相互作用によって生ずる。]
[0007] 「付着細胞」、「接着細胞」は、基質の外面に付随し続けるか固定化されているか何からの形で接触している細胞、株（化）細胞もしくは細胞系（例えば、原核細胞、真核細胞）を意味する。培養後のこのタイプの細胞は洗浄及び培地・培養液交換プロセスに抵抗する（耐える）ことができる。上記プロセスは多くの細胞ベースのアッセイに必要なものである。「弱付着細胞」は、細胞培養の間、基質の表面に弱く相互作用するか付随するか接触している細胞、株（化）細胞もしくは細胞系（例えば、原核細胞、真核細胞）を意味する。しかしながら、このタイプの細胞（例えば、ＨＥＫ（human embryonic kidney）細胞、ヒト胎児由来腎臓細胞）は物理的に妨害（邪魔）する手法（例えば、洗浄や培地・培養液交換）によって基質表面から容易に分離・解離する傾向を有している。「浮遊細胞」は、適切に所定の培地・培養液（この中で細胞が培養中に基質表面に付着・接着しない）で培養された細胞もしくは株（化）細胞を意味する。「細胞培養」は原核細胞もしくは真核細胞を管理された（コントロールされた・制御された）条件下で成長させるプロセスを意味する。「細胞培養」は多細胞真核生物から得られる（由来する）細胞（特に動物細胞）の培養だけでなく、例えば、複合組織及び器官・臓器の培養も意味する。]
[0008] 「細胞」等は半透膜によって外部境界が形成された原形質の小さな通常は顕微鏡的な（鏡検によって見出される）マス（mass：量、かたまり、もの）を意味し、１つもしくは複数の核及び種々の他のオルガネラ（小器官）を含む場合もあり、単体でもしくは他の細胞と相互作用することにより、生命の全ての基本的機能を行うことができると共に独立して機能することができる生物体の構造上の最小単位（例えば、合成細胞コンストラクト、細胞モデル系その他の人工的細胞系）を形成するものである。]
[0009] 「細胞系」等は２タイプ以上の細胞の集合（体）・群または１つのタイプの細胞の分化型・形・形態の集合（体）・群を意味する。この集合（体）・群の細胞は互いに相互作用し合い、その結果、生物学的、生理学的もしくは病態生理学的な機能を行う（発揮する）。このような細胞系は例えば、器官、組織、幹細胞、分化肝細胞その他の系またはこれらの組み合わせを含む。]
[0010] 「抗体」もしくは「Ａｂ」等はタンパク質生体分子または生体分子ミミック（典型的にはＹ形状のものであり脊椎動物の血液もしくは他の体液の中に見つけることができる（例えば、可溶性の膜結合しているか膜遊離している形態及び、単クローンの、多クローン性の、自然の、合成の、操作された形態で））を意味する。坑体は免疫系（システム）によって使用され、表面抗原との反応により異物や病原体・菌（例えば、バクテリアやウイルス）を識別（確認、検知）して中和する。]
[0011] 「マーカー、標識（marker）」等は、少なくとも１つの細胞ターゲット・標的（例えば、Ｇq共役受容体、Ｇs共役受容体、Ｇi共役受容体、Ｇ12/13共役受容体、イオンチャネル、受容体チロシンキナーゼ、トランスポータ（輸送体）、ナトリウムプロトン交換輸送体、核内受容体、細胞キナーゼ、細胞タンパク質等）の活性・活動を調節することができる分子、生体分子、生物学的物質を意味し、バイオセンサにより測定できる信頼度の高い検出可能な出力もしくはシグナルを生成することができる。目的とする細胞ターゲット（標的）のクラス及びその後の細胞事象に依存するが、標識（マーカー）は例えば、アクティベータ（activator：活性化因子、活性化剤）（例えば、アゴニスト、部分アゴニスト、インバースアゴニスト）であり、Ｇタンパク質共役受容体（ＧＰＣＲ：G protein-coupled receptor）、受容体チロシンキナーゼ（ＲＴＫ：receptor tyrosine kinase）、イオンチャネル、核内受容体、細胞酵素アデニレートシクラーゼその他の細胞ターゲットに使用される。標識は例えば、特定のターゲットに結合して活性化するリガンドであるか、別のターゲットに結合して活性化する分子（その後上記特定のターゲットをトランス活性化する）である。]
[0012] 「検出」、「検出する」等は、バイオセンサを用いて細胞ターゲットに対する刺激（物質）の相互作用を発見もしくは検知する（センシングする）本発明のシステム、装置及び方法の能力を意味する。]
[0013] 「刺激物質」、「治療候補物質・化合物」、「治療候補（物質）」、「予防候補（物質）」、「予防剤・薬」、「リガンド候補（物質）」等は、自然のもしくは人工的な分子もしくは物質・材料であって、バイオセンサに付着する細胞と相互作用する可能性（能力）について注目すべきものを意味する。刺激（物質）は他の化学剤・薬品・物質（または光化学なもの、メカニカルな（人口的な、機械的な）もの、電気的なもの、またはこれらの組み合わせ）をさらに含むこともあるし、上記した分子、物質、材料に代わる化学剤・薬品・物質（または光化学なもの、メカニカルな（人口的な、機械的な）もの、電気的なもの、またはこれらの組み合わせ）を含むこともある。治療候補物質もしくは予防候補物質は例えば、化学物質、バイオロジカルモレキュラ（biological molecule：生体分子、生物学的分子）、ペプチド、タンパク質、生体（生物学的）サンプル、薬候補（薬品候補、薬剤候補）の小分子、薬（品）候補の生体分子、薬（品）候補の小分子生物学的コンジュゲート（drug candidate small molecule-biologic conjugate）等の材料、物質、モレキュラエンティティ（分子実体）またはこれらの組み合わせを含む。この治療候補物質もしくは予防候補物質は、細胞ターゲットまたは病原体（菌）ターゲット（例えば、生細胞のタンパク質、ＤＮＡ、ＲＮＡ、イオン、リピド（脂質）その他の構造物もしくは成分）の少なくとも一方に（と）特異的に結合するか相互作用することができるものである。]
[0014] 「バイオセンサ」等は分析物もしくは相互作用の検出のためのセンサ装置（デバイス）を意味する。バイオセンサは生物学的（生体）コンポーネント（成分、要素）を物理化学的な検出（器）コンポーネント（成分）に結合することができる。典型的なバイオセンサは３つの部分からなる。３つの部分とは、生物学的（生体）成分・要素（例えば、組織、微生物、病原体（菌）、細胞、もしくはこれらの組み合わせ）と、検出（器）成分・要素（例えば、物理化学的な形態（例えば、光学的、圧電式、電気化学的、サーモメトリック（thermometric）的、磁気的な形態）で動作する）と、上記２つの成分・要素に付随する（関連付けられた）トランスデューサである。生物学的（生体）成分・要素は例えば、生細胞、病原体（菌）もしくはこれらの組み合わせを含む。実施例では、光学バイオセンサは、例えば、生細胞、病原体（菌）もしくはこれらの組み合わせにおける分子認識（識別）もしくは分子刺激事象を検出可能で数量化（定量化）できるシグナル（信号）に変換する光学トランスデューサを有することもある。]
[0015] 「上皮（細胞）増殖・成長因子」すなわち「ＥＧＦ（epidermal growth factor）」は細胞の成長、増殖及び分化の制御（調整、レギュレーション）に重要な役割を果たす成長因子を意味する。ヒトＥＧＦは５３のアミノ酸残基と３つの分子内ジスルフィド結合からなる６０４５Ｄａタンパク質である。ＥＧＦは高い親和性（親和力）で細胞表面のＥＧＦＲに結合し、受容体の内在タンパク質チロシンキナーゼ活性を刺激することにより作用する。その後、チロシンキナーゼ活性により、シグナル伝達カスケードが開始され、細胞内で種々の生化学的変化（例えば、細胞内カルシウムレベルの上昇、糖分解の増加、タンパク質合成の増加、所定遺伝子（ＥＧＦＲの遺伝子を含む）の発現の増加）が生ずる。最終的に、これはＤＮＡ合成及び細胞増殖に至る場合がある。]
[0016] 「上皮（細胞）増殖・成長因子受容体」すなわちは「ＥＧＦＲ（epidermal growth factor receptor）、ＥＧＦ受容体」は細胞表面の特定の受容体であり、その特定のリガンド（ＥＧＦ及びトランスフォーミング増殖因子α（ＴＧＦα）を含む）の結合により活性化されるものを意味する。ＥＧＦ受容体はＥｒｂＢファミリの受容体に属し（ＥｒｂＢファミリのメンバであり）、これは４つの関連性の深い受容体チロシンキナーゼ（ＥＧＦＲ（ＥｒｂＢ−１）、ＨＥＲ２/ｃ−ｎｅｕ（ＥｒｂＢ−２）、Ｈｅｒ３（ＥｒｂＢ−３）及びＨｅｒ４（ＥｒｂＢ−４））のサブファミリーである。関連するＥｒｂＢ−３及びＥｒｂＢ−４受容体はニューレグリン（ＮＲＧｓ）により活性化される。ＥｒｂＢ−２を直接活性化するリガンドは知られていないが、構成的（恒常的）に活性化状態にあると考えられる。その成長因子リガンドにより活性化されると、ＥＧＦＲは不活性な単量体状態からアクティブな（活性性の、能動的な）ホモダイマーに遷移する。但し、予め生成された不活性な二量体も、リガンド結合の前に存在するだろうという証拠がある。リガンド結合の後にホモ二量体を形成することに加え、ＥＧＦＲはＥｒｂＢ受容体ファミリの別のメンバ（例えば、ＲｒｂＢ２/Ｈｅｒ２/ｎｅｕ）と対をなして活性化されたヘテロ二量体を生成することもある。また、活性化されたＥＧＦＲのクラスタが形成されることを示唆する証拠もある。但し、このクラスタ化が活性化自体に重要なのか、あるいは、個々の二量体の活性化に続いて発生するのかは不明である。]
[0017] 「トランス活性化」等は、別の細胞受容体（例えば、ＧＰＣＲ）に結合してこれを活性化するリガンドにより引き起こされる受容体（例えば、ＥＧＦＲ）の活性化を意味する。細胞調整メカニズム（機構）の作用の結果、当該受容体がトランス活性化される。このようなトランス活性化は異なる細胞シグナリングシステムの間における通信では一般的な原理である。これにより、細胞はその環境からの多くのシグナル（信号）を統合することができる。例えば、ＥＧＦＲのトランス活性化はＧＰＣＲとＲＴＫの間のクロストークのパラダイム・規範を示している（例えば、文献「Gschwind, A., et al. “Cell Communication Networks: Epidermal Growth Factor Receptor Transactivation as the Paradigm for Interreceptor Signal Transmission” Oncogene, (2001), 20 (13), 1594-1600」を参照されたい）。別の例としては、カルバコール（ＧＰＣＲムスカリン受容体リガンド（刺激薬））を用いたＨＥＫ２９３細胞のＫｖ１．２カリウムイオンチャネルのトランス活性化がある。トランス活性化リガンド、トランス活性化マーカーもしくはトランス活性化分子は、対象としているターゲット受容体を間接的に活性化することができるリガンド、マーカー（標識）もしくは分子を意味する。この活性化は、直接ターゲット受容体に結合して活性化するのではなく、細胞内調整もしくはシグナリングメカニズムにより行われると考えられる。]
[0018] 本明細書においては当業者に周知の略語（例えば、ｈもしくはｈｒは時間の略語として、ｇもしくはｇｍはグラムの略語として、ｍＬはミリリットルの略語として、ｒｔは室温（room temperature）の略語として、ｎｍはナノメートルの略語として）が使用されることがある。]
[0019] 名詞の前に「１つ」もしくは「複数の」または特定の量・数を示す表現が無い限り、当該名詞の量・数は「少なくとも１つの」または単数もしくは複数であることを意味する。]
[0020] 「含む」等の表現は、目的語となっているものを有するが、それに限定されないことを意味する。]
[0021] 実施例の説明において使用される「約」、「略」、「およそ」、「ほぼ」等の修飾語（例えば、組成中の成分の量、濃度、体積・容積、プロセス（処理）温度、プロセス（処理）時間、歩留り、収率・収量、流量、圧力その他の値及びこれらの範囲に使用される）は、例えば、化合物、組成物、濃縮物、使用製剤を作る際の通常の計測・測定や取扱・処理で生じ得る数値の変動を意味する。また、「約」等の修飾語は上記計測等における不可避的誤差や、その方法を実施するために使用される原料もしくは成分の製造者（社）、供給源もしくは純度の違いその他の要因により生じ得る数値の変動を意味する。「約」等は特定の初期濃度や混合量（混合比）を有する組成物もしくは製剤の径時変化（濃度や混合比の変化・相違）も含み、特定の初期濃度や混合量（混合比）を有する組成物もしくは製剤を混合したり処理することにより生ずる変化・相違も含む。「約」等の表現で修飾されているかどうかに拘わらず、本出願の特許請求の範囲（本発明）は当該量・数値の均等物を含む。]
[0022] 実施例で使用される「実質的に…から成る・構成される」という表現は、例えば、本明細書のエバネッセント波無標識光及びエバネッセント波励起蛍光発光検出のためのシステム、生細胞を特徴づける装置（本明細書の上記システムを含む）、本明細書の生細胞を特徴づける方法、１つのセンサからのエバネッセント波無標識シグナル及びエバネッセント波励起蛍光シグナルの１つの共鳴波長の検出を強化（機能強化、機能向上）・改善・補助する方法、並びに、本明細書で説明されている物、デバイスもしくは装置に用いられる。また、「実質的に…から成る」という表現は特許請求の範囲に記載された構成要素もしくはステップを含むと共に、当該組成物、物、装置及び本明細書に記載されたもの（例えば、特定の反応物、特定の添加物、特定の成分、特定の薬剤、特定の細胞、特定の株化細胞、特定の表面モディファイア（変更因子）、特定の表面状態（条件）、特定のリガンド候補その他の構造体、材料、物質もしくは選択されたプロセス変数）の製造・使用方法の基本的且つ新規な特徴に大きな影響を与えない他の構成要素もしくはステップも含むという意で用いられることもある。]
[0023] よって、請求項に記載された発明は、適宜、下記のもののいずれかを含むか、下記のものいずれかから成るか、下記のもののいずれかによって実質的に構成される。]
[0024] エバネッセント波無標識光及びエバネッセント波励起蛍光発光を検出するシステム、
前記システムを含む生細胞を特徴付ける装置、
生細胞を特徴付ける方法、
１つのセンサからのＥＷ無標識シグナル及びＥＷ励起蛍光発光シグナルの１つの共鳴波長の検出を強化・改善する方法、及び
生細胞内のイオンチャネル活性を検出する方法。]
[0025] 本願の幾つかの態様・特徴は下記の米国特許出願に関連している（本願の出願人とこれら米国特許出願の出願人は同じである）。]
[0026] 米国特許出願第１１／０２７，５４７号（出願日２００４年１２月２９日、発明の名称「Spatially Scanned Optical Reader System and Method for Using Same」、出願公開番号２００６０１４１６１１Ａ１、公開日２００６年６月２９日）。]
[0027] 米国特許出願第１１／０２７，５０９号（出願日２００４年１２月２９日、発明の名称「Method for Creating a Reference Region and a Sample Region on a Boisensor and the Resulting Biosensor」、出願公開番号２００４０１４１５２７Ａ１、公開日２００６年６月２９日）。例えば図１には、１つのバイオセンサ上に参照（基準）領域とサンプル領域を生成する３つの異なる方法が示されている。] 図１
[0028] 米国特許出願第１１／２１０，９２０号（出願日２００５年８月２３日、発明の名称「Optical Reader System and Method for Monitoring and Correcting Lateral and Angular Misalignments of Label Independent Boisensors」、出願公開番号２００６０１３９６４１Ａ１、公開日２００６年６月２９日）。この米国特許出願には、光学リーダー（reader）システムが記載されている。この光学リーダーシステムは走査された光ビームを使用してバイオセンサに応答指令信号を送り（バイオセンサをインターロゲートし）、生体分子結合事象がバイオセンサの表面で起きたかを判定している。実施例では、光学リーダーシステムは例えば、光源と、検出器と、プロセッサ（例えば、コンピュータ、デジタル信号プロセッサ（ＤＳＰ））を含む。光源は光ビームを発し、当該光ビームは移動するバイオセンサに照射・走査され、この間、検出器がバイオセンサから共鳴反射された光ビームを集光する。あるいは、光源からの光ビームはセンサ全体を照らし、その間、検出器がセンサ全体からの光ビーム（バイオセンサから共鳴反射された光ビーム）を画像化する。プロセッサは集光された光ビームを処理して、生成される生のスペクトルデータもしくは角度データを記録する。これらデータはバイオセンサ上の位置（及び時間）の関数である。その後、プロセッサは生データを分析し、共鳴波長（ピーク位置）もしくは共鳴角度の空間マップを生成する。この空間マップは、生体分子結合事象もしくは細胞事象がバイオセンサ上で起きたか否かを示す。生データの上記以外の用途も説明されている。]
[0029] 米国特許出願第６０／７８１，３９７号（出願日２００６年３月１０日、発明の名称「Optimized Method for LID Boisensor Resonance Detection」、出願番号１１／７１６４２５、出願日２００７年３月９日）。]
[0030] 米国特許出願第６０／８４４，７３６号（出願日２００６年９月９日、発明の名称「Active Microplate Position Correction for Boisensors」）。]
[0031] 米国特許出願第１１／７１１，２０７号（出願日２００７年２月２７日、発明の名称「Swept Wavelength Imaging Optical Interrogation System and Method for Using Same」）。]
[0032] 構成要素、コンポーネント、成分、添加物、細胞タイプ、坑体その他、及びこれらの範囲について記載されている特定の（好ましいとされる）値は例示に過ぎない。記載されていない（明示されていない）値を排除する意図はないし、記載された範囲内の明示されていない値を排除する意図もない。本発明の組成（物）、成分、構成、装置及び方法は、本明細書に記載された値（一般的な値、特定の値、好ましい値）及びそれらの組み合わせを含む。]
[0033] 本発明は、固定化細胞もしくは生細胞における標識とは無関係な（独立している、依存していない）刺激誘発光学シグナルと標識に依存する蛍光発光シグナルを同時に検出するバイオセンサシステムを提供する。標識依存検出及び標識非依存検出の両方とも、バイオセンサから得られるエバネッセント波を利用する。本発明は細胞反応の高処理量システム（ＨＴＳ：high throughput system）分析に適した方法を提供する。また、本発明は典型的には光学シグナル（信号）もしくは蛍光発光シグナルまたはこれらシグナルの双方と干渉することができる薬、剤もしくは化合物をスクリーニングするのに適した方法も提供する。さらに本発明は、広いスペクトル・範囲でエバネッセント波励起蛍光発光の適用を可能にする方法を開示する。]
[0034] 本発明は無標識で且つ非観血（非侵襲性）で高いシグナル特異性を有する光学（的な）バイオセンサベースの（バイオセンサを使用した）細胞分析（アッセイ）方法を提供する。このようなバイオセンサは標識を用いず（有さず）、統合された（完全な）細胞応答（これは、プロービング細胞生物学のダイナミックマス再分布（ＤＭＲ：dynamic mass redistribution）と称される）を提供することができる。ＤＭＲシグナルは受容体の活性化の後の細胞プロセスからの（から得られる）多くの寄与物によって構成され得る。従って、これらバイオセンサベースの細胞分析は１つの細胞プロセス（通常、従来の細胞分析技術を使用して計測される）だけに適用されるものではない（特異的でない）と考えることができる。特定の（特異的な）細胞プロセスに付随するエバネッセント波励起蛍光発光を計測することにより、バイオセンサベースの細胞分析は伝統的な細胞分析に統合することができる。統合した計測により、補完的で補強的な情報を提供することができ、後述する細胞生物学に新しい見識・考えを与えることができる。]
[0035] 当初、細胞シグナリング（シグナル伝達）は直線的な経路を通って行われると考えられていた。この場合、１つの細胞外シグナルが直線的な反応連鎖の引き金（トリガ）となり、１つの明確な反応を生成していた。しかしながら、継続的な研究により、外的な刺激（物質）に対する細胞反応はかなり複雑であることが判明し、多くの共通の分子を含む複数の相互作用経路が関与していることが分かった。これら経路は単にシグナル伝達をしているだけでなく、例えば、内部シグナル及び外部シグナルを処理したり、符号化したり、統合したりすることもある。細胞は、外部シグナルからの刺激に対する応答をする場合、高度にダイナミックなネットワークの様な相互作用に依存している（相互作用を起こしている）。刺激に対する特定の（特異的な）分子を介するシグナル伝達経路の組み合わせ統合は、細胞応答及び細胞機能の特異性（例えば、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）のシグナル伝達）に重要な役割を果たしている。リガンド結合が行われると、ＥＧＦＲは二量体化し、細胞質領域（ドメイン）内のチロシン残基上の受容体の自動（自己）リン酸化によって活性化する。その結果、多くの細胞内シグナルが別のシグナリングタンパク質と相互作用することによって惹起される（生成される）。しかしながら、細胞反応の特異性の大部分はシグナリングネットワーク相互作用の統合（組み込み、完成）によって決まり、細胞状況（コンテクスト、前後関係）に依存する。予想通り、ＲＷＧバイオセンサ標識非依存型アッセイ（測定、分析）は次のことを示している。即ち、静止状態（無活動状態）において、０．１％ウシ胎児血清を使用してＥＧＦでＡ４３１細胞を刺激すると用量依存ＤＭＲシグナルが生成され、当該シグナルは、０％ウシ胎児血清を使用した完全に静止状態のＡ４３１細胞で得られるもの（Fang, Y., Biophys. J. 2006, 91, 1925-1940）比べて遅い動態（運動量、速度）と小さな振幅（広さ）を示す（Fang, Y., et al., Anal. Chem. 2005, 77, 5720-5725）。対称的に、化学化合物を使用してＥＧＦＲシグナル伝達経路における細胞内ターゲットの活性（化）を選択的に変更・調整するケミカルバイオロジー（化学生物学）の研究によって、特定のシグナル伝達経路下流ＥＧＦＲとＥＧＦ誘発ＤＭＲシグナルとの間にリンク（関連）が見つかった。ＥＧＦ誘発ＤＭＲシグナルはＥＧＦＲチロシンキナーゼ活性、アクチン重合及びダイナミンを必要とし、主にＭＥＫを介して進む。さらに、ポジティブＤＭＲフェーズ（Ｐ−ＤＭＲ：時間が経過すると増大するシグナル）は主に細胞内ターゲットが活性化受容体に転位することが原因であり、ネガティブＤＭＲフェーズ（Ｎ−ＤＭＲ：時間が経過すると減少するシグナル）は受容体内部移行と細胞脱離の組み合わせが原因である。このようなケミカルバイオロジー分析は、ＥＧＦ誘発ＤＭＲシグナルが１つの特異的な細胞シグナリング（シグナル伝達）事象に関連していないことを示している。つまり、ＥＧＦ誘発ＤＭＲシグナルがＥＧＦＲ活性の下流（後）の多くの細胞事象の組み合わせ・統合によるものであることを示している。その結果、各ＤＭＲフェーズの動態パラメータを特定の細胞事象にリンクさせることは難しい。また、ＤＭＲシグナル全体は非特異的にシグナル伝達経路もしくは１つのシグナリング事象に関連しているとも見ることができるが、それはＥＧＦＲターゲットに特異的である（Fang, Y., et al., Anal. Chem., 2005, 77, 5720-5725）。逆に、エバネッセント波励起蛍光発光の測定結果（本願のＮＩＲ色素標識化ＥＧＦ（図１２）を使用した例において示されている）によれば、ＮＩＲ色素標識化ＥＧＦを追加した後の時間経過に伴う蛍光発光強度の変化は主に２つの主要な事象に関連していると考えられる。理論・学説に限定されて（定められて）いないが、蛍光発光強度の最初の増加は蛍光発光により標識化されたＥＧＦが培養細胞の基底細胞膜にある受容体へ結合したために生じたと考えられ、その後の蛍光発光強度の減少は受容体が結合蛍光発光ＥＧＦと共に内部移行したために生じたと考えられる。このような結果は、ＥＧＦ分子が拡散・分散し、センサ検出ゾーン内にある基底（細胞）膜表面に位置するＥＧＦＲに結合できることを示している（上部（上層）膜表面はセンサ表面から遠いので、色素標識化ＥＦＧの結合は現在のセンサでは容易に検出することができない）。この結合により蛍光発光強度が増大し、この動態は標識非依存型ＤＭＲ測定法を用いたＰ−ＤＭＲフェーズの場合に似ている。さらに、内部移行が生ずるための時間は、完全に静止状態の細胞（０％ウシ胎児血清）についてＰ−ＤＭＲからＮ−ＤＭＲへ変化する時間と一致する（矛盾しない）。受容体内部移行は結合標識化ＥＧＦを細胞内へ移動することであると考えられる。この移動により、蛍光発光強度が減少する。このような結果から、標識非依存型及び標識依存型アッセイはお互いを確認することが出来るし、下流ＥＧＦＲが標識非依存型測定（部）にシグナル伝達するという特定の細胞事象に特異性を与えることが出来る、ということが分かる。さらに、２つの測定を組み合わせると、どのようにＥＧＦが細胞表面で受容体に結合するかについて、及び、いつどのようにＥＧＦＲシグナリング（シグナリル伝達）が進行するのかについて完全な・統合的なイメージが得られる。]
[0036] 本発明の実施例では、エバネッセント波無標識光検出とエバネッセント波励起蛍光発光検出のためのデュアル検出システムが提供される。]
[0037] このシステムは、
光センサと、
前記センサを照射する光源と、
前記センサから（の）エバネッセント波無標識光及びエバネッセント波励起蛍光発光を収集する光検出システムもしくは光検出器と、
収集した光を分析するプロセッサとを含む。
本発明の他の実施例では、エバネッセント波無標識光検出とエバネッセント波励起蛍光発光検出のための他のデュアル検出システムが提供される。
このシステムは、
光センサと、
前記センサを照射する光源と、
前記センサからのエバネッセント波無標識光を収集する光検出システムもしくは光検出器と、
前記センサからのエバネッセント波励起蛍光発光を収集する第２光検出システムもしくは第２光検出器と、
収集した光を分析するプロセッサとを含む。]
[0038] 前記光センサは例えば、１つの光センサであってもよいし、マイクロプレートに設けられ導波路グレーティングに接続された複数のセンサのアレイ（複数のセンサが所定配置で設けられたもの）であってもよいし、その他の同様な構成のものであってもよい。前記光源は例えば、ファイバに接続された調整可能なレーザシステム（例えば、約４００ナノメートルから約９００ナノメートルの波長を有する複数の調整可能レーザまたはこのような複数のレーザの組み合わせ。尚、前記波長以外の波長であってもよし、前記波長範囲内の波長範囲であってもよいし、前記波長範囲以外の範囲であってもよい。）である。前記センサの光源照射は次のように選択される（決定される）。即ち、当該照射によって所定の蛍光発光標識が励起されるように選択される。所定の標識とは、直接的にもしくは間接的にセンサ表面との関連性を有する標識である。また、この照射によって、センサ表面に付随している細胞のＤＭＲ（dynamic mass redistribution）事象に関連したエバネッセント波無標識光が得られる。光検出システムもしくは光検出器は例えば、自己参照（基準）型の干渉計を含む。自己参照型の（即ち、波長参照型の）干渉計はレーザ光源波長をダイナミックに（状況に応じて）測定するのに使用することができる。これについては例えば、米国特許第５，３０５，０７４号を参照されたい。光検出システムによって収集された光は例えば、エバネッセント波無標識光、エバネッセント波蛍光標識発光もしくはこれらの組み合わせである。]
[0039] 蛍光（発光）検出及び画像化（イメージング）システムの典型的な構成要素・コンポーネントは例えば、光源（例えば、キセノンもしくは水銀アーク放電ランプ）、励起フィルタ、ダイクロイックミラー（もしくはダイクロマティックビームスプリッタ）及びエミッションフィルタである。このようなフィルタ及び二色性の部品は、刺激（物）にラベル付け（標識付け）するために使用されるフルオロフォア（fluorophore）の発光特性及びスペクトル励起にマッチする（合う）ように選択することができる。本発明の実施例ではデュアル検出システムは例えば、第１ビームスプリッタと第２ビームスプリッタを有する。第１ビームスプリッタは光源の励起ビームの入射角を調整し、第２ビームスプリッタはＥＷ無標識反射光とＥＷ励起蛍光発光標識発光を選択する。]
[0040] デュアル検出システムの実施例において、ＥＷ無標識光を収集するための検出システムもしくは検出器はＥＷ励起蛍光発光標識光を収集するための光検出システムもしくは光検出器と別のシステム（検出器）であってもよいし、両者が一体化されていてもよい。本発明の実施例では光検出システムもしくは光検出器は例えば、ＥＷ無標識光を収集するための第１デジタルカメラとＥＷ励起蛍光発光標識光を収集するための第２デジタルカメラとを有する（例えば、図２Ｃ参照）。] 図２Ｃ
[0041] 光センサは１つもしくは複数のセンサ（例えば、複数のセンサのアレイ）からなる。複数のセンサは例えば、マイクロプレート部品に用いられる。マイクロプレート部品は複数の取り付けられたもしくは埋設されたバイオセンサを含む。本発明の光センサは他の部品や用途にも使用することができる。]
[0042] 適切な光源は例えば、調節可能なレーザ等の光源（例えば、１つもしくは複数のセンサを波長スイープ光で照射することができる調整可能なレーザ）である。この光源を使用して、バイオセンサアレイ内の各バイオセンサがシステマティックに（例えば、同時に、あるいは、所定規則・順序従って連続的に、あるいは所定グループ毎に）照射される。共鳴波長はアレイ内のセンサ毎に異なっているかもしれないが、レーザビームは本明細書で説明される照射光学系（常に設けられるわけではない）を通過させることができ、その結果、レーザビームを拡張させてセンサエリアのかなりの部分もしくはセンサエリアの全体を照射することができる。よって、前記調節可能な照射源（光源）は照射用光学系を含む。]
[0043] センサからの光を集める光検出システムの一例は、エリア走査（スキャン）イメージセンサを有するデジタルカメラである。このデジタルカメラはデジタル化出力部を備えるエリア走査イメージセンサを有しており、例えば、前記調整可能なレーザが前記センサを走査すると、前記デジタルカメラはスペクトルイメージ（分光画像、スペクトル画像）を記録することができる。実施例では、このデジタルカメラは画像化光学系を有してもよい。この光学系は、デジタルカメラによって受信及び記録できるように、センサ生成光（学）画像の条件設定をする。]
[0044] 実施例では上記システムはさらに、次のものを少なくとも１つ有してもよいし、これらの組み合わせを有してもよい。即ち、上記システムは、コリメータレンズ、プラスマイナス（＋）１ｎｍの帯域を有する励起フィルタ、光（学）シャッター、偏光制御器、イメージング（画像化）レンズ、ノッチフィルタ及び蛍光発光フィルタの少なくとも１つもしくはこれらの組み合わせをさらに有してもよい。]
[0045] 本発明の実施例では生細胞を特徴づけるための装置が提供される。この装置は、前記システムと前記任意のコンポーネント・部品のいずれを含んでもよいし全てを含んでもよい。前記システムはセンサの表面（例えば、照射される表面の反対側の表面）に付随する生細胞を有する。]
[0046] 本発明の実施例では、生細胞を特徴づける方法が提供される。この方法は、
センサの表面に固定化された生細胞を有する前記システムに基づいて（基づいた）別のシステムを準備するステップと、
前記センサの表面に固定化された生細胞に付随している選択されたターゲットに対して、第１の蛍光発光標識化刺激を与える（準備する）ステップと、
前記固定化された細胞を前記第１の蛍光発光標識化刺激に接触させるステップと、
前記センサのＥＷ無標識光及びＥＷ蛍光発光を調べる（インターロゲートする）ことによって、前記第１の蛍光発光標識化刺激が前記ターゲットに接触したことにより生ずる効果（作用、影響）を検出するステップと、
前記センサのＥＷ無標識光及びＥＷ励起蛍光発光を第２の刺激がある場合と無い場合とで比較するステップを含む。]
[0047] 実施例では、前記第２の刺激は追加のプローブ・探索子（標識化刺激（標識付けされた刺激）あるいは標識化されていない刺激）として使用することができる。但し、この第２の刺激は少なくとも前記第１の蛍光発光標識化刺激とは異なる刺激である。前記第１の刺激と第２の刺激は例えば、別々にもしくは同時に加えることができる。２つの追加ステップがある場合、刺激追加順序はバイオセンサの用途等によって決められる。実施例では、標識化刺激は例えばまず、第２の刺激に対する標識化刺激の効果（作用、影響）を判断するためのアッセイ（分析）において加えられる。反対に、第２の刺激を先に加えてもよい。即ち、最初に第２の刺激が、蛍光標識化刺激誘発光学出力シグナルに対する第２の刺激の効果（作用、影響）を判断するためのアッセイに加えられてもよい。]
[0048] 本発明の実施例では、生細胞を特徴づける別の方法が提供される。この方法は、
センサの表面に固定化された生細胞を有する前記システムに基づいて（基づいた）「生発現（live-expression）」システムを準備するステップを含む。生細胞は例えば、蛍光発光ターゲットを能動的に・活発にもしくは断続的に発現するか、すでに発現している。]
[0049] 前記方法はさらに、
前記固定化された細胞を刺激に接触させるステップと、
前記センサのＥＷ蛍光発光をインターロゲートすることによって、前記蛍光ターゲットに対する前記刺激の効果（作用、影響）を検出するステップと、
ＥＷ無標識光における刺激誘発変化を検出するステップを含む。]
[0050] 実施例では、刺激は異なる細胞ターゲット（つまり、蛍光ターゲットではないターゲット）に結合して当該ターゲットを活性化することができる。刺激結合ターゲットの活性化によって、蛍光ターゲットは基底細胞膜表面に向かって移行・転位（置）するか、基底細胞膜表面から離れるか、バイオセンサのセンシングボリューム（検出容積・範囲）の外に出る（いずれの移動が起きるかは、例えば、蛍光ターゲットの細胞局在性に依存する）。生細胞内の蛍光ターゲットの発現は例えば、遺伝子発現ベクター（媒介物）を使用することによって達成される（生じさせることができる）。遺伝子発現ベクターは例えば蛍光たんぱく質（例えば、緑色蛍光たんぱく質（ＧＦＰ）、黄色蛍光たんぱく質（ＹＦＰ）、赤色蛍光たんぱく質（ＲＦＰ）、長波長蛍光たんぱく質（例えば、近赤外蛍光たんぱく質）その他の蛍光たんぱく質）を含む。あるいは、生細胞内の蛍光ターゲットの発現は例えば、トランスフェクション（transfection：導入、移入）法を使用して直接蛍光プローブもしくは蛍光たんぱく質を細胞内へ移送することによって達成される（生じさせることができる）し、インコーポレーション（incorporation：取り込み、組み入れ）法を使用して選択的に蛍光脂質分子を細胞表面膜に組み入れることによって達成される（生じさせることができる）。インコーポレーション法は蛍光脂質分子（例えば、膜電位感応色素分子もしくは蛍光タグ化脂質分子（例えば、Cy5標識化1,2ジパルミトイルホスファチジルエタノールアミン（Cy5-DMPE）、クマリン結合リン脂質（CC2‐DMPE）もしくはナノゴールドタグ化脂質））を利用することができる。蛍光脂質分子は強い脂質と脂質の相互作用によって細胞表面膜に直接入ることができる。]
[0051] 本発明の実施例では１つのセンサからのＥＷ無標識シグナルとＥＷ励起蛍光発光シグナルの１つの共鳴波長の検出を強化する方法が提供される。この方法は、
蛍光発光標識を有する特異的ターゲットのＥＷ励起蛍光発光シグナルを測定し、刺激に対する無標識ＤＭＲ（dynamic mass redistribution）シグナルを測定するステップと、
ターゲットから発っせられ前記ステップで計測された蛍光発光シグナルと無標識光シグナル（ＤＭＲシグナル）とを相関させるステップを含む。]
[0052] 本発明の実施例では、１つのセンサからのエバネッセント波無標識シグナルとエバネッセント波励起蛍光発光シグナルの１つの共鳴波長の検出を強化・改善する別の方法が提供される。この方法は、
蛍光発光標識を有する特異的ターゲットのエバネッセント波励起蛍光発光シグナルを測定し、刺激に対する無標識ＤＭＲシグナルを測定するステップと、
前記蛍光発光シグナルと無標識ＤＭＲシグナルとを相関させるステップを含む。]
[0053] 蛍光発光シグナルと無標識ＤＭＲシグナルとを相関させるステップは、例えば、２つのシグナルの動態プロフィール・特性を比較すること、シグナル伝達カスケードを変えることにより２つのシグナルの調節（モジュレーション）プロフィールを比較すること、細胞反応に対する遺伝子変更の影響を比較すること、の少なくとも１つもしくは全てを含むことができる。]
[0054] 本発明の実施例では、生細胞を特徴づけるための他の方法が提供される。この方法は、
バイオセンサの表面に固定化された生細胞（この生細胞は蛍光ターゲットを有している）を有する前記バイオセンサシステムを用意するステップと、
前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、
前記センサのエバネッセント波蛍光発光をインターロゲートすることにより、前記蛍光ターゲットにおける刺激誘発変化を検出するステップと、
前記エバネッセント波無標識光における刺激誘発変化を検出するステップを含む。]
[0055] 実施例では、蛍光発光ターゲットを有する生細胞は例えば蛍光たんぱく質を発現する遺伝子発現ベクターによって得られる。実施例では蛍光発光ターゲットを有する生細胞は、例えば、ターゲットを生細胞へ移送するトランスフェクション法によって得られるか、脂質ターゲットを細胞表面膜に入れることによって得られるか、これら２つの手法の組み合わせによって得られる。]
[0056] 本発明の実施例では、エバネッセント波無標識光検出及びエバネッセント波励起蛍光発光検出のためのデュアル検出システムが提供される。このシステムは、
光センサと、
前記光センサを照射する光源と、
前記センサからのエバネッセント波無標識光を収集する第１光検出器と、
前記センサからのエバネッセント波励起蛍光発光を収集する第２光検出器と、
前記収集した光を分析するプロセッサとを含む。]
[0057] 光センサは例えば、所定パターンの基準領域、生細胞もしくは生体分子を有する（が設けられた・位置する）サンプル領域、またはこれら領域の組み合わせを備える。]
[0058] 本発明の実施例では、生細胞内のイオンチャネル活性のデュアル検出システムが提供される。]
[0059] 本発明の実施例では、生細胞内のイオンチャネル活性のデュアル検出方法が提供される。この方法は例えば、
バイオセンサ表面上に固定化された少なくとも１つの生細胞を有するバイオセンサを準備するステップと、
膜電位感応色素を前記固定化された細胞に与える（例えば、固定化細胞を色素に浸す）ステップと、
前記浸されて付いた膜電位感応色素を有する前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、
刺激誘発光学無標識シグナルとエバネッセント波励起蛍光発光シグナルを検出するステップを含む。]
[0060] 本発明の実施例では、生細胞内のイオンチャネル活性のデュアル検出の他の方法が提供される。この方法は、
バイオセンサ表面上に固定化された少なくとも１つの生細胞を有するバイオセンサを準備するステップと、
膜電位感応色素及び蛍光脂質を前記固定化された生細胞に与えるか、前記固定化された生細胞を膜感応色素及び蛍光脂質に浸すステップと、
浸された前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、
刺激誘発光学無標識シグナル及びエバネッセント波励起蛍光発光シグナルを検出するステップを含み、蛍光発光シグナルは色素と脂質の間の蛍光共鳴エネルギ伝達における変化に基づいて変化する。]
[0061] 本発明の実施例では、生細胞内のイオンチャネル活性のデュアル検出の他の方法が提供される。この方法は、
バイオセンサ表面上に固定化された少なくとも１つの生細胞を有するバイオセンサを準備するステップと、
膜電位感応色素及びクエンチャ（消光剤）脂質を前記固定化生細胞に与えるか、前記固定化生細胞を膜感応色素及びクレームエンチャ脂質に浸すステップと、
浸された前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、
刺激誘発光学無標識シグナル及びエバネッセント波励起蛍光発光シグナルを検出するステップを含み、前記検出された蛍光発光シグナルは前記クエンチャと膜電位感応色素の間の距離の変化に基づいて変化する。]
[0062] 本発明の実施例では、可視光源を備えるＲＷＧバイオセンサが提供される。この可視光源はバイオセンサに対しほぼ（公称上）垂直な入射角を有し、エバネッセント波光学ＤＭＲシグナル及びエバネッセント波励起蛍光発光シグナルの検出に使用される。蛍光発光シグナルは少なくとも１つの可視励起波長を有して膜電位感応色素から生成され得る。膜電位感応色素は例えば、基底細胞膜の中にある。実施例では、一対の蛍光脂質（例えば、膜電位感応色素と蛍光脂質）は近接しているときは蛍光発光共鳴エネルギ伝達を行うことができ、アッセイ許容範囲もしくは検出感度をさらに増大するのに使用することができる。実施例では、一対の膜取り込み分子（例えば、膜電位感応色素と蛍光発光クエンチャ脂質）を選択することができる。このクエンチャは近接しているときは膜電位感応色素の蛍光発光を抑制する（失くす）ことができ、例えば、アッセイ許容範囲や検出感度を増大するために使用することができる。]
[0063] 本発明の実施例では、エバネッセント波バイオセンサを使用して生細胞内のイオンチャネル活性のデュアル検出もしくはマルチモード検出をするためのシステム及び方法が提供される。本発明では、基底細胞膜表面に付随する蛍光発光分子の局所的励起のために、従来の蛍光発光イオンチャネル細胞アッセイよりもアッセイ感度が高いシステム及び方法が提供される。さらに、イオンチャネルＤＭＲと膜電位媒介（調整）蛍光発光シグナルを同時に検出することができるので、本発明の方法は例えば、偽（擬）陽性検出及び偽（擬）陰性検出を減ずることができる場合がある。偽陽性及び偽陰性の検出は従来の蛍光発光細胞アッセイ技術を使用するとしばしば生じてしまう。]
[0064] 本発明の実施例では、イオンチャネル活性に特異的且つ直接的に結び付いている生細胞のエバネッセント波励起蛍光発光シグナル及びエバネッセント波ベースＤＭＲシグナルを検出することができるシステム及び方法が提供される。このシステム及び方法は、公称垂直角度でバイオセンサに入射する可視波長光に使用することができる特異的ＲＷＧバイオセンサを使用すると共に１つの膜電位感応色素（または互いの距離が近接しているとき蛍光発光共鳴エネルギ伝達をすることができる一対のドナー（提供）色素及びアクセプタ（受容）色素）を使用する。このシステム及び方法は無標識光応答と膜電位関連蛍光発光シグナル（例えば、イオンチャネルオープナ（例えば、リガンド、電位、機械的な力その他の手段、またはこれらの組み合わせ）により誘発されたもの）の検出を可能にする。]
[0065] イオンチャネルは大きな・主なクリニカルインジケータ（臨床評価指標）を有するターゲットグループを提示するが、適切で迅速で且つ生物学的に優れたアッセイ手法が無かったために、これに対応することは難しかった。イオンチャネルは生体膜を通過する（生体膜全体の）イオンの動きを制御・調整し、細胞機能を維持したり調節・変更する際に重要な（決定的な）役割を果たす。イオンチャネルは薬（剤）ターゲットとしての重要度は高いが、イオンチャネルモジュレータの高スループット（処理量）スクリーニングは難しく長時間を要する（特に電位開口型（電位作動型）イオンチャネルの場合、難しく且つ長時間を要する）。従来、パッチクランピング法が主流であった。このような電気生理学的手法では、一日当たりに比較的少数のサンプルをスクリニーングすることしかできなかった。放射性リガンド結合アッセイは、結合サイト（部位）を前もって知る必要があるので、不便である。また、他のサイト（部位）もアロステリックに結合する可能性があるという点からも、放射性リガンド結合アッセイは不都合なものである。よって、価値ある結果が得られない可能性がある。]
[0066] 機能（的）アッセイは理想的にはイオンチャネル機能のモジュレータを発見するのに理想的に適したものである。しかし、現在利用可能な放射性（放射活性のある）エフラックス（efflux：流出、外向き電流、外向き流束）アッセイは細胞をロードするのに大量の放射性トレーサを必要とする。８６ルビジウム（86Rubidium）エフラックスアッセイ（カリウムチャネルを研究するために通常適用される）を原子吸光分析を用いて無放射性フォーマットへ転換・変更することにより放射性トレーサが不要となったが、この方法でもスループットが制限される（高くない）。イオンチャネル機能を測定する１つの手法はマイクロフィジオメトリ（microphysiometry）を使用した測定である。この測定では、細胞内の全ての（任意の）変化に応じて細胞外ｐＨがどのように変化するかをモニターすることができる。読み取り装置（リーダー）は市場入手できるものであり、アッセイは広い範囲（多くの種類）のターゲットに適用可能であるが、スループット（処理量、処理能力）は制限されたままである。なぜなら、測定時間（期間）が長いし、必要とされる細胞の数が多いからである。蛍光発光アッセイの進歩によって、適切なアッセイ技術のポートフォリオが大きく強化・改善された。]
[0067] カルシウムチャネルの活性は蛍光イメージ（ング）プレートリーダ（ＦＬＩＰＲ：Fluorescent Imaging Plate Reader）等のシステムでカルシウム感応色素（例えば、Fluo-3蛍光色素）を使用して測定することができる。膜電位の間接測定は、例えば、DiBac色素（ビスバルビツール酸オキソノール）のシリーズから選択されたオキソノール色素を用いてＦＬＩＰＲにより行うことができる。この測定により、膜電位の変化に伴う分布の変化を知ることができ、全細胞画像をその後に付けることができる。電圧感応蛍光発光プローブを使用して、チャネルの活性をモニターすることができる（例えば、オーロラ社の電圧／イオンプローブリーダ（Aurora社、Voltage/Ion Probe Reader：ＶＩＰＲ）を使用する）。しかし、このような蛍光測定はホールセル（細胞全体）レベルで行われるので、そのシステムはしっかりとしたアッセイを行うためには蛍光発光共鳴エネルギ伝達を伴う電圧感応蛍光発光色素の使用を必要とする。]
[0068] システムと方法
本発明の実施例では、エバネッセント波光放射（発光）（例えば、屈折率変化）とエバネッセント波蛍光発光とを、バイオセンサ表面領域のインターロゲーション（調査・観察・検出）もしくは画像化（発光の検出及び分析を含む）に基づいて測定するためのシステム及び方法が提供される。表面領域のインターロゲーションは例えば、２つの別個の相補的な方法によって行うことができる。実施例において、インターロゲーションはバイオセンサ表面を走査（スキャン）してセンサ表面の画像を構築（生成）することによって行われる。実施例では、インターロゲーションは、バイオセンサ表面からの蛍光発光とバイオセンサ表面（から）の屈折率変化の画像を同時に得ることにより行われる。本発明のシステム及び方法は例えば、診断検査（アッセイ）もしくは治療検査（アッセイ）を行うために用いることができる（例えば、エバネッセント波標識非依存検出のスキャンとエバネッセント波蛍光発光検出のスキャンのために用いることができる）。実施例では、１つもしくは複数のバイオセンサをマイクロプレートのウエルに設けてもよい。そして、本発明のシステム及び方法を用いて１つもしくは複数のバイオセンサをインターロゲーションして、バイオセンサ表面上もしくはその近傍に存在するターゲットと予期される結合分析物との間の結合情報（とを繋げる情報）を提供することができる。本発明の実施例のシステム及び方法を使用して、バイオセンサ表面に付着した生細胞と刺激との間の相互作用もしくはシグナリング情報を提供することができる。]
[0069] 本発明の実施例では、バイオセンサを分析して、例えば、生細胞内に細胞物質（の再分布）が存在するのか及び生細胞内における細胞物質の再分布の範囲がどれくらいなのかを判断する方法が提供される。この方法は、
バイオセンサの表面に付随している（例えば、固定化されている）生細胞を有するバイオセンサに照射して走査するステップと、
エバネッセント波無標識シグナルの検出とエバネッセント波蛍光発光シグナルの検出を同時に行うステップと、
無標識シグナル及び蛍光発光シグナルを細胞物質の再分布に相関させる（両者の相互関係を明らかにする）ステップを含む。]
[0070] 実施例では、シグナルを細胞再分布に相関させるステップは幾つかの異なる手法によって行うことができる相関分析によって実施される。例えば、当該相関させるステップは２つのシグナルの動態パラメータを比較することによって実施することができる。なぜなら、２つのシグナルは細胞反応の径時変化を示しているからである。あるいは、前記相関させるステップは、モジュレータ（例えば、細胞ターゲットを通るグナル伝達経路の細胞ターゲットに対するインヒビタ（抑制剤）もしくはアクティベータ（活性化剤））による細胞反応のモジュレーションプロフィールを比較することによって実施される。この細胞ターゲットは、刺激が相互作用しているターゲット（刺激相互作用ターゲット）である。あるいは、前記相関させるステップは、細胞反応に対する遺伝子変化の影響（インパクト）を比較することによって実施される。遺伝子変化（の影響）は例えば、遺伝子ノックアウトや干渉ＲＮＡを利用して知ることができる遺伝子サイレンシング（発現抑制）、または、遺伝子トランスフェクション法を利用して知ることができる遺伝子過発現である。この場合、例えば、遺伝子は、刺激相互作用ターゲットを介するシグナル伝達カスケードにある細胞タンパク質をコード化する。あるいは、前記相関させるステップは、上記した以外の手法により実行されてもよいし、上記した手法の組み合わせによって実行されてもよい。]
[0071] 無標識光（学）シグナルは統合された細胞反応を表している。統合された細胞反応は多くの下流シグナリング事象（特に細胞物質（質量）の大きな移動を含む事象）から構成される。下流シグナリング事象は特異的細胞ターゲット（例えば、ＧＰＣＲもしくは受容体チロシンキナーゼ）の刺激誘発活性を介して起きる。対称的に、蛍光発光シグナルは特異的細胞プロセス（例えば、蛍光分子がそのターゲットに結合すること、刺激に応じて蛍光分子が移動すること、またはこれら２つの事象）に直接関連している。しかしながら、細胞シグナリング（シグナル伝達）は一連の空間的及び時間的事象によってコード化され得るし、細胞制御メカニズム（機構、仕組み）は細胞反応の統合に非常に重要な役割を果たすことがある。従って、２つのシグナルは共通の動態プロフィールを共有する場合がある。例えば、ＥＧＦ誘発光信号における当初のＰ−ＤＭＲ事象から次のＮ−ＤＭＲ事象への移行時間（静止状態のＡ４３１細胞でＲＷＧバイオセンサを使用して測定する）は、受容体脱感作プロセス（シグナル伝達カスケードのリン酸化（ホスホリレーション）により制御されるプロセス）に関連していることが分かった。このホスホリレーションはまた、受容体内部移行プロセスにも必要である。図１２Ａに示されるように、標識化ＥＧＦ誘発反応についてのエバネッセント波励起蛍光測定でも、蛍光発光強度の最初の増加から次の減少までほぼ同じ移行時間を要している。後者の変化（発光強度減少）は受容体内部移行による。よって、動態分析をすると、ＥＷにより生じた光シグナルをＥＷにより励起された蛍光シグナルに相関させることができる。さらに、Ａ４３１細胞をダイナミン（dynamin）インヒビタ（ダイナミン抑制性ペプチド）で前処理することにより、Ｐ−ＤＭＲシグナルとＮ−ＤＭＲシグナルの双方における減少フェーズをかなり弱めることができる（Fang, Y. et al. Anal. Chem., 2005, 77, 5720-5725及び図１２Ｂ参照）。このようなダイナミンインヒビタによるモジュレーションプロフィールは次の事の証拠・根拠となる。即ち、当該モジュレーションプロフィールはＥＧＦ（標識化されているか標識化されていない）誘発ＥＷ生成光シグナルにおけるＮ−ＤＭＲ事象を標識化ＥＧＦ誘発ＥＷ励起蛍光シグナルの蛍光発光の減少に相関させる根拠となる。]
[0072] 実施例においてバイオセンサ接触面は例えば、現像しなくてもよいし、改良（改質）しなくても良い場合もある。従って、本発明の方法は例えば、きれいな、未現像もしくは未使用のマイクロプレートその他の加工（人工）表面におけるバイオセンサの質に関係する基準データもしくはベースライン（データ）を判断（決定）するのに使用できるツールを提供することができる。これに加え（あるいはこれに代えて）、バイオセンサ接触面は現像もしくは改質してもよい（例えば、予め、あるいは生体内原位置で、あるいは両方で）。よって、例えば、本発明の方法は化学的アッセイ、薬理学的アッセイ、生物学的アッセイその他のアッセイにおいてマイクロプレート内のバイオセンサから得られるデータの質を判断する適切なツールとなることができる。バイオセンサ表面パターン（パターニング）は、化学物質もしくは対象ターゲットの固定化を防止する（その結果、分析物が固定化ターゲットに結合するのを防止する）物質によってバイオセンサの特異的な（特定の）表面を選択的にブロックすることにより作ることができる。これに加え（あるいはこれに代えて）、パターン形成（パターニング）を利用して生細胞の付着を防止することができ、その結果、生細胞の反応を刺激に与えることを防止することができる。例えば、バイオセンサにＥＭＡ（poly(ethylene-alt-maleic anhydride：エチレン−無水マレイン酸共重合体)）等のポリマ（一級アミンに対して反応性を有する）をコーティングし、従来のコンタクトプリント法もしくはスタンピング法によってバイオセンサの全体のうちの小さなエリアを小分子（例えば、アミノエタノール）によりブロックする。他の例では、バイオセンサはＳＭＡ（styrene-maleic anhydride copolymer：スチレン−無水マレイン酸共重合体）等のポリマでコーティングされる。このポリマは一級アミンに対して反応性を有する。そして、例えば、コンタクトプリント法もしくはスタンピング法により、バイオセンサの表面の小さな部分をポリエチレングリコール（アミン終端を有する）でブロックする。その後、当該表面の残りの部分のコーティングを細胞外基質（ＥＣＭ：extracellular matrix）により行う。細胞外基質は例えば、フィブロネクチン、コラーゲンもしくはゼラチンである。上記の結果として得られるプリブロックされた（予めブロックされた）エリアは細胞付着に対して抗力を有し、培養された細胞は選択的にＥＣＭ物質存在（提示）エリアに結合する。]
[0073] 実施例ではバイオセンサ装置は例えば、マイクロプレート内に設けられた複数のバイオセンサを含む。マイクプレートは例えば、９６個のウエルもしくは３８４個のウエルを有するか、同程度の数のウエルを有する（シングルウエル、マルチウエル、コンパウンドウエルを含む）。これに加え（あるいはこれに代えて）、バイオセンサは他の適切な形態を有してもよい。]
[0074] 本発明の実施例では、生細胞応答を判定するシステムが提供される。このシステムは、
複数のウエルが形成されたフレームを有するマイクロプレート（各ウエルには基準領域とサンプル領域を有する面を備えたバイオセンサが組み込まれている）と、
前記バイオセンサに設けられ、前記サンプル領域にのみ付着した１つもしくは複数の細胞を有する生細胞培養物（液）と、
前記バイオセンサの一部を照射する光ビーム光学系と、前記照射されたバイオセンサからの反射共鳴光及びＥＷ励起蛍光発光を受光する画像光学系と、前記照射されたバイオセンサを走査して、当該バイオセンサからの一連の画像を捕捉（キャプチャ）する画像化装置とからなる光学リーダ・インターロゲータ（optical reader-interrogator）と、
前記獲得した走査データを本明細書に開示された複数の方法のいずれかにより処理するプロセッサと、を含む。]
[0075] 本発明の実施例では、バイオセンサ等のセンサのための光学インターロゲーションシステムが提供される。このシステムは、
前記バイオセンサに光ビームを発する照射装置と、
前記バイオセンサからの光ビーム及びＥＷ励起蛍光発光を別々にもしくはまとめて集光して、当該集光された光ビーム及び蛍光発光に対応するシグナルを出力するレシーバと、
本明細書に開示された複数の方法のいずれかに基づいて、前記シグナルを処理して生細胞反応を判定（判断）するプロセッサと、を含む。]
[0076] 実施例において、前記プロセッサは例えば、プログラマブルコンピュータ、デジタル信号プロセッサ（ＤＳＰ）その他の装置（本発明のシステム及び方法の計算処理、コンピューティング処理、比較処理、選択処理その他の処理ができる装置）である。]
[0077] 本発明の実施例では、米国コーニング社の装置であるＥｐｉｃ（米国登録商標）標識非依存検出システムが標識非依存生化学的結合検出システムとして使用できる。このシステムは３８４ウエルのマイクロプレートと光学リーダとから構成される。マイクロプレートの各ウエルには光学バイオセンサが設けられている。光学リーダによりマイクロプレートをインターロゲートする。各ウエルは小さな（例えば、約２ｍｍｘ２ｍｍ）光学グレーティング（共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）として知られているもの）を含んでもよい。このグレーティングにより反射される光の波長は、ウエル内のセンサの表面における光学屈折率の高感度（敏感な）関数である。従って、物質（例えば、タンパク質、抗体、薬剤、細胞等）がウエル底部もしくはセンサ表面に結合すると、共鳴反射された波長は変化することになる。あるいは、刺激物（例えば、コンパウンド（化合物）、薬剤、生物、薬剤候補、治療剤等）がバイオセンサ表面に付着した生細胞に付随するターゲットもしくは生細胞と反応（もしくは相互作用）すると、共鳴反射された波長は変化することもある。]
[0078] 光学リーダ（走査された標識非依存検出に使用され、ＳＬＩＤ（scanned label-independent detection）と称される）は、１つもしくは複数の集束（focused）光ビームを使用する。この光ビームはマイクロプレートの底部（即ち、固定化細胞もしくはサンプルから見て反対側）を横切って（あるいは底部全体を）走査するように照射され、各光学センサからの反射波長を測定する。リーダ（読取装置）を使用して、各センサからの反射波長の変化を時間の関数としてモニタ（監視）してもよい。また、リーダを使用して、各センサ内の位置（即ち、空間的に解像された情報もしくは画像（化）情報）の関数として波長及び波長変化を評価してもよい。]
[0079] 生化学物質がセンサの表面に結合すると、ローカル（局所）屈折率が変化し、光学センサにより反射された波長も変化する。リーダは各ウエル内の生化学的事象を計測するために、この波長変化を検出して定量化する（数値で表現する）。センサに衝突する光は、当該光の波長と入射角（当該光波のベクトル（wave vector：ウエーブベクトル））の組み合わせが適切であれば、導波路に共鳴結合される。]
[0080] 反射波長（もしくは反射角度）を時間の関数としてモニタすることにより、その物質がセンサの表面に結合されているかセンサの表面から離れているかを判断することができる。典型的なアッセイでは、まず例えば、タンパク質もしくは細胞をマイクロプレートのバイオセンサの表面に固定化する。次に、ベースラインの読み取りもしくは測定を行う。即ち、マイクロプレート内の各センサによって反射された波長が測定されて記録される。次に、結合化合物（例えば、薬剤化合物もしくは薬剤候補）または刺激物がウエルに加えられ、第２の波長読み取りが行われる。２つの読み取りの間で生ずる波長シフトは、どれくらの薬剤もしくは刺激物がマイクロプレートのバイオセンサの表面に結合したかを示す測定値となる。同じ様に（しかし基本的には異なるが）、細胞シグナリングの研究において、生細胞がセンサ表面に接触させられる。培養後、ベースラインの読み取りが行われる。即ち、プレート内の各バイオセンサによって反射された波長が測定され記録される。その後、刺激物が生細胞を有するウエルへ導入され、第２の波長読み取りが行われる。第２の波長読み取りは連続的に行ってもよいし（時間変化を見る測定）、不連続で行ってもよい（例えば、エンドポイント測定）。刺激を加える前と後の波長シフトもしくは波長差は、センサ表面に付着した生細胞の反応の測定値である。]
[0081] 実施例では、もし必要であるならば、各センサの一部を化学的もしくは物理的にブロックして、例えば、対象ターゲットの結合や生細胞の付着を防止することができる。ブロックされたエリア（部分）は環境変化により生ずる誤った（偽）波長シフトを除去する基準シグナルとして作用することができる。環境変化とは例えば、大きな屈折率変化、物質漂流（ドリフト）、非特異的な化合物結合、熱的事象（発熱、吸熱、加熱、冷却等）である。インターロゲーションシステムはサンプル領域からのシグナルと基準領域からのシグナルを区別することができなければならない。これらシグナルはセンサの帯域内のほとんどの波長で生じ得るし、同じ偏光を有している可能性もある。実施例では、ウエル内基準部（例えば、各ウエルの小さな部分を化学的にブロックすることができる所）は空間的にローカルな（局所的な）基準（部）として作用することができる。]
[0082] 過去数十年に亘って、色々な無標識光学バイオセンサが開発されてきた。これらバイオセンサは、例えば、生体分子相互作用の動態及び結合親和性に関する詳細な情報を提供してくれる。このようなバイオセンサはしばしば親和性ベースのバイオセンサと称される。バイオセンサ機器及び実験装置・設備の継続的改良により、広い範囲の（色々な）相互作用をより詳細に分析することが可能になった。その一例は、小さな分子が固定化受容体に結合することを直接検出することができるようになったことである。これは特に、ドラッグ（薬剤）スクリーニングにおいて用いられる。]
[0083] 薬（剤）発見のパラダイムはターゲット指向の手法からシステムバイオロジ中心の手法へと変化し始めているので、細胞ベースのアッセイにおける光バイオセンサの使用が増えてきている（例えば、Fang, Y., (2006) Assays and Drug Development Technologies, 4:583-595参照）。生細胞の刺激誘発応答を検査する無標識光バイオセンサの能力は、浸透・侵入（ペネトレーション）深さもしくはセンシングボリューム内での生細胞の分布もしくは局所的質量密度の変化を検出するバイオセンサのエバネッセント波に対する感度に依存している。共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）バイオセンサは例えば、多くのクラスの細胞ターゲットの活性化及びシグナリングの研究に使用されており、細胞もしくは細胞系の動き（行動、振る舞い）の研究にも使用されている。このような非観血的（非浸襲的）で無標識の細胞アッセイは他の無標識エバネッセント波ベースのバイオセンサ（例えば、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ：surface plasmon resonance）装置もしくは共鳴ミラー）を用いて行うこともできる。フォトニッククリスタル（photonic crystal）バイオセンサも、共鳴導波路グレーティングバイオセンサの一例である。このような非観血的バイオセンサベースの細胞アッセイは、無標識で統合（integrated）細胞反応を計測することができる。得られる光シグナルはＤＭＲ（dynamic mass redistribution）シグナルと称され、刺激により誘発され、その性質上、特異的な細胞ターゲットもしくは経路に対して非特異的である。刺激誘発光シグナルもしくはＤＭＲシグナルを特異的なターゲットに結びつける（リンクさせる）ためには、例えば、ＤＭＲシグナルに関与している細胞ターゲット、細胞事象もしくは経路に関する知識が必要である（Fang, Y., et al., (2005) Anal. Chem., 77: 5720-5725及びFang, Y., et al., (2005) FEBSLett., 579: 6365-6374参照）。]
[0084] バイオセンサ技術
バイオセンサは分子認識（識別）事象を定量化可能なシグナルに変換するための特定のトランスデューサを複数備えている。複数のトランスデューサそれぞれの性質に基づいて、トランスデューサを異なるタイプのバイオセンサにカテゴライズ（分類分け）することができる。例えば、熱量測定バイオセンサ、アコースティック（acoustic）バイオセンサ、電気化学的バイオセンサ、マグネティックバイオセンサ、光学バイオセンサその他に分類することができる。バイオセンサは無標識で分子認識もしくは相互作用を調べる場合に広く使用されている。典型的には、生体物質（例えば、リガンド、機能タンパク質、坑体）をバイオセンサの表面に接触させ、生体層を形成することができる。ターゲット分析物と生体物質の層との間の相互作用によって、トランスデューサの物理的性質に変化（例えば、共鳴反射光の内容・量の変化）が生ずる。このような変化は検出器によって検出することができ、サンプル中のターゲット分子の結合を直接定量化（数値化）する際に用いることができる。あるいは、細胞の層をセンサ表面に接触させてもよい。その後、刺激（物）を与えて細胞と反応させ、トランスデューサの物理的性質に変化を生じさせる。このような変化は検出器によって検出することができ、生細胞の反応を定量化する際に用いることができる。そして、それは生細胞内のターゲットもしくは刺激（物）の機能のインジケータとして使用することができる。上記ターゲットは当該刺激（物）が反応もしくは相互作用するターゲットである。最近は幾つかのタイプのバイオセンサ技術（主に、インピーダンスベースの電気バイオセンサ及びエバネッセント波ベースの光バイオセンサ）が、生理（学）的条件下における細胞活性（活動、動作）を調べるために使用されるようになってきた。]
[0085] エバネッセント波ベースの細胞アッセイ
多くの光バイオセンサが開発されてきた。例えば、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）バイオセンサ、共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）バイオセンサ及び共鳴ミラーバイオセンサなどが開発されてきた。これらのうち、ＳＰＲバイオセンサ及びＲＷＧバイオセンサが最も一般的である。この２つのバイオセンサはエバネッセント波を利用して、センサ表面における（もしくはその近傍における）生体層の変化もしくは分子相互作用を特徴付けることができる。エバネッセント波は溶液と表面とのインターフェースにおける光の全内部反射により生成される電磁場であり、通常、バイオセンサ表面から短い距離・深さ（例えば約数百ナノメートル）だけ溶液内に存在する。この深さをペネトレーション（侵入）深さもしくはセンシング（検出）ボリュームと称する。]
[0086] ＳＰＲバイオセンサはプリズムを使用して、偏光された光のウエッジ（wedge）（入射角の所定範囲をカバーする）を平面ガラス基板に向け（導き）、表面プラズモンを励起する。このガラス基板は電導性金属フィルム（例えば、金膜、金層）を有している。その結果として得られるエバネッセント波は金層の自由電子雲と相互作用して自由電子雲に吸収され、電子電荷密度波（表面プラズモ）を生成し、反射光の強度を低下させる。この強度が最低になる共鳴角度は、センサ表面の反対側の金層に近い溶液の屈折率の関数である。これに対し、ＲＷＧバイオセンサは回折格子によって光を導波路へ共鳴結合させている。所定範囲の入射波長を有する偏光された光を用いて、導波路を直接照射する。このとき、特定の（特異的な）波長の光が導波路に結合され、導波路に沿って伝播する。結合効率が最大となる共鳴波長はバイオセンサの表面もしくはその近傍における局所的屈折率の関数である。サンプル中のターゲット分子が固定化受容体に結合すると、共鳴波長がシフトする。]
[0087] 細胞ベースのアッセイの場合、分離（単離）受容体ではなく生細胞がバイオセンサの表面に（と）接触させられるか相互作用させられる（通常、培養によって）。細胞付着は幾つかのタイプの接触（例えば、接着点（フォーカルコンタクト）、クロースコンタクト（close contact）、細胞外基質（ＥＣＭ）接触）によって為される。各接触・コンタクトはそれぞれセンサ表面から特徴的な分離距離を有する。ほとんどの細胞内生体高分子は微細繊維網のマトリックスによって規律正しく構成・配置されていることが知られている。また、その位置はかなり規則正しいので細胞は例えば特異的で郊率的なタンパク質相互作用を行うことができ、空間的にタンパク質活性化メカニズムと非活性化メカニズムを分離し、特異的細胞機能及び反応を判断することができる。刺激を受けると、細胞タンパク質の大きな移動が起こることがしばしばあり、その結果、ダイナミックで（動的で、大きな）所定方向に進む質量再分布（ＤＭＲ（dynamic mass redistribution）と称される）が生ずる。ＤＭＲは、センシングボリューム内で生ずるならば、光バイオセンサによって検出することができる。得られたＤＭＲは生細胞の一意的な（唯一の、独特な、特有な）生理（学的）シグナルとなり得る。このシグナルは例えば、受容体の活性をモニタしたり、受容体のシステム−細胞生物学の研究をしたり、薬剤候補のシステム細胞薬理学を調べたりする際に使用できる。本発明のバイオセンサベースの細胞アッセイ方法は広い範囲の細胞及び細胞ターゲット（例えば、ＧＰＣＲ、受容体チロシンキナーゼ、イオンチャネル、キナーゼ等）に適用することができる。]
[0088] １．光バイオセンサ
無標識バイオセンサには多くのタイプがある。これらバイオセンサのほとんどは、分子相互作用の分析用に構成されている。共通の特徴は、ある種のトランスデューサを使用して、表面と溶液のインターフェース（境界）における分子相互作用を検出することである。他のタイプのバイオセンサ（例えば、熱量測定トランスデューサ、音響トランスデューサ、電気化学トランスデューサもしくは磁気トランスデューサ等を使用するバイオセンサ）と同様に、光バイオセンサは分子認識事象を定量化可能なシグナルに変換する光学トランスデューサを含む。]
[0089] 多くの光バイオセンサ機器が市場において入手可能である。例えば、生体分子相互作用の動態判断用のＳＰＲベースのシステム（例えば、バイオコア社のＢＩＡＣＯＲＥ３０００）、パラレル結合検出用のプラズモンイメージャ（Plasmon Imager）（グラフィニティファーマシューティカル社）、標準ＳＢＳマイクロプレートフォーマット（ほとんどが３８４ウエルマイクロプレート）を使用した高スループットスクリーニング用のＥｐｉｃシステム（コーニング社）が市場入手可能である。]
[0090] 本発明の実施例においては、マルチモード検出能力を有する光バイオセンサシステムが提供される。これは例えば、エバネッセント波ベースのバイオセンサ（例えば、プラズモン共鳴バイオセンサ、共鳴ミラーバイオセンサ、フォトニック結晶バイオセンサ、もしくは共鳴導波路グレーティングバイオセンサ）に適している。このようなバイオセンサはエバネッセント波を利用して、例えばセンサ表面における（もしくはその近傍における）分子的相互作用、構造的相互作用、生細胞の化学機械電気誘導反応（chemo-mechano-electrical induced response）、細胞と細胞の相互作用を特徴付けることができる。エバネッセント波は電磁場であり、溶液と表面のインターフェースにおける光の全内部反射により生成され、通常は短い距離（約数百ナノメートル）だけ溶液内に延びる（特有の深さをもって）。この特有の深さはペネトレーション深さもしくはセンシングボリューム（sensing volume）と称される。市販されているシステムはそれぞれかなり異なった動作原理、スループット、サンプル供給プロセス及び用途で作動するが、全ての光バイオセンサに共通な特徴はセンサ表面（もしくはそのごく近傍）における局所的な屈折率の変化を計測できることである。]
[0091] 表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）
ＳＰＲはプリズムを使用して、偏光された光（所定範囲の入射角をカバーする）のウエッジ（wedge）を平なガラス基板に向ける。ガラス基板は金の薄いフィルムを有しており、表面プラズモンを励起する。共鳴角度（反射光の強度が最小になる角度）は、センサ表面の反対側の金層に近い溶液の屈折率の関数である。]
[0092] 共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）システム
ＲＷＧバイオセンサは、回折格子を介した光の導波路への共鳴結合を利用する。偏光された光（所定範囲の入射波長をカバーする）を使用して導波路を照射する。特定の波長の光を導波路に結合させ、導波路に沿って伝播させる。共鳴波長（結合効率が最大になるところ）はセンサ表面における（もしくはその近傍）の局所的屈折率の関数である。高スループットスクリーニング（ＨＴＳ：high throughput screening）及び細胞ベースのアッセイに関して、ＲＷＧバイオセンサは多くの利点を提供する。適切な構成を有するこのタイプのバイオセンサを用いると、公称垂直の入射角の光でバイオセンサを照射することができる。垂直な入射角で照射できることは、多数のバイオセンサを同時に照射するための重要な構造上のパラメータである。同時照射（できること）はＨＴＳの望ましい特徴である。ＨＴＳはＳＢＳ（Society for Biomolecular Sciences：http://www.sbsonline.org）標準マイクロタイタープレート（例えば、３８４ウエルマイクロプレート）内のサンプルを直接アッセイ（分析）するものである。]
[0093] インターフェロメトリー（干渉法）システム
干渉法ベースのバイオセンサは分光器を使用し、バイオセンサインターフェースからの反射光における干渉パターンを捕捉する。生体分子がバイオセンサ表面に結合すると、その厚さは例えば増大し、当該結合は例えば分光計の干渉パターンの変化を分析することによってモニター（観測）することができる。]
[0094] ２．光バイオセンサベースのイメージングシステム
通常、光バイオセンサ装置はバイオセンサを使って、サンプル中のターゲット分子がバイオセンサ表面に固定化された受容体に結合したかをモニターする。得られた結合シグナルは通常、決められたエリア（照射ビームのサイズ（例えば、２００ミクロン）及びバイオセンサ内で移動する結合光の伝搬距離（例えば、ＲＷＧバイオセンサの場合、約２００ミクロン）によって決まるエリア）における結合による平均的な反応を示している。サンプル中のターゲット分子が固定化受容体に結合するのを高解像度で画像化することができる市販の光バイオセンサシステムには色々なクラスのものがある。これらシステムは、ＳＰＲ画像化（イメージング、画像処理）システム、エリプソメトリ画像化システム及びＲＷＧ画像化システムを含む。]
[0095] 例えば、ＳＰＲイメージャ（Ｉｍａｇｅｒ）ＩＩ（ＧＷＣテクノロジー社）はプリズム結合されたＳＰＲを使用し、固定入射角におけるＳＰＲ計測値を取り、ＣＣＤカメラにより反射光を集める。表面における変化は、反射率変化として記録される。よって、ＳＰＲイメージングでは、アレイの全ての要素に関する計測値を同時に集めることになる。]
[0096] エリプソメトリ（ellipsometry）も、検出器としてＣＣＤカメラを使用することによって、イメージングエリプソメトリとして実施することができる。この手法は、サンプルのリアルタイムのコントラストイメージ（画像）を提供する。それによって、フィルム（膜）厚及び屈折率に関する情報を得ることができる。高度・高性能なイメージングエリプソメータ技術は伝統的なヌル（null）エリプソメトリ及びリアルタイムエリプソメトリコントラストイメージングの原理に基づいて動作する。この場合、１波長エリプソメータ設定で、光源としてレーザを使用する。レーザビームは、リニア偏光子と１／４波長板を通過した後、楕円形に偏光される。楕円偏光された光はサンプル以外のところに（で）反射され、分析器を通過し、長い作動距離の対物レンズによってＣＣＤカメラに結像する。計測されたデータをコンピュータ化された光学モデルで分析すると、空間的に解像された膜厚と複素屈折率の値を演算（推測）することができる。]
[0097] コーニング社はイメージングベースの使用（用途）のためのＲＷＧバイオセンサに基づいたスイープ波長光学インターロゲーションシステムも開示している。このシステムでは、高速調整可能レーザ光源を使用してマイクロプレートフォーマットのＲＷＧバイオセンサのアレイもしくはセンサを照射する。センサスペクトルは、レーザ波長で走査すると、時間の関数としてセンサから反射された光パワーを検出することによって構成することができる。計測データをコンピュータ化された共鳴波長インターロゲーションモデリング法で分析すると、細胞層もしくは固定化受容体を有するバイオセンサの空間解像イメージが得られる。画像センサを使用すると、当然、イメージングベースのインターロゲーションスキームになる。２次元無標識画像を、可動部無しで得ることができる。]
[0098] ３．エバネッセント波（ＥＷ）励起蛍光発光
エバネッセント波励起蛍光発光は、バイオインターフェースをプロービングするのに用いることができる。これは通常、全内部反射蛍光発光（ＴＩＲＦ：total internal reflection fluorescence）を使用して行うことができる。エピ（epi）蛍光発光の場合とは異なり、エバネッセント波はフィールド（場）のペネトレーション深さ内の標識化分子だけを励起する。これによりバルク（bulk）シグナルから干渉を排除・除去することができる。ＴＩＲＦの場合、光はプリズムもしくは高開口数の液浸対物レンズを介して、基質（基板）のインターフェースに結合される。ここで、全内部反射により、光は基質（基板）の全長にわたり導かれる。]
[0099] エバネッセント波が高度に閉じられた（拘束された、制限された）導波路モードもしくは表面プラズモを介して生成されると、強い局所場（local field）が長い相互作用部分に結合し、その結果、従来のＴＩＲＦに比べ蛍光発光が著しく強化される（例えば、約１０−約１００倍の表面強化になる）。ＳＰＲの場合、エバネッセント波の強化はフルオロフォアの金属表面までの距離に大きく依存するので、検出はばらつく傾向にあり、クエンチング（quenching：消光）を起こす場合もある。金属表面（例えば、金）によるフルオロフォアのクエンチングは距離に依存しており、通常それは短い距離（例えば、数ナノメートル未満）で生ずる。このようなクエンチングは、ＲＷＧバイオセンサが使用される場合には起きない。従って、シングルモードの導波路から生成されたエバネッセント波（ＥＷ）は非常に感度が高く且つ定量化可能な表面結合標識（もしくは付随・関連する標識）計測値を表す。]
[0100] エバネッセント波（ＥＷ）強化蛍光発光は１９８５年には提案されていた（リファレンス１）。従来の平面導波路は高屈折率物質（例えば、Ｎｂ2Ｏ5、Ｔｉ2Ｏ5、ＴｉＯ2、ＳｉＮ等、もしくはこれらの組み合わせ）から作ることができる。光はプリズムもしくは表面グレーティングを介して導波路に結合することができる。導波路グレーティングカプラ（coupler）ベースのＥＷ蛍光発光技術はゼプトセン社及びマイクロバキューム社により商品化された（リファレンス２）。ゼプトセン社の装置は、平面導波路検出領域からのグレーティング結合領域の分離に基づく手法を採用している。マイクロバキューム社の技術はＯＷＬＳ（optical waveguide lightmode spectroscopy：光導波路ライトモード分光器）として知られている（リファレンス３）。センサは導波路グレーティングカプラに似ているが、光検出器が平面導波路の遠い端に設けられる。光は共鳴入射角で導波路に結合される。同じようなスキームが報告されている（リファレンス４及び５）。]
[0101] 平面導波路は無標識検出における重要な技術でもある（リファレンス２及び６）。導波路表面の屈折率の小さな変化はグレーティングカプラの共鳴条件のシフトとなって現れる。よって、エバネッセント波（ＥＷ）は、表面限定（surface confined、表面に閉じ込められた）蛍光発光励起と屈折率のセンシングの両方に使用することができる。このような機能・能力については報告書が存在している（リファレンス７及び８）（ＯＷＬＳチップ及びリーダを使用）。ＯＷＬＳはその検出スキームの故に、シングルチャネルに限定されるか、最も良い場合でも一次元アレイの検出に限定される。]
[0102] ゼプトセン社及びノヴァーティス社（リファレンス９−１２）の装置は、光を導波路フィルムに結合させる際に別の領域を使用し、結合された光が導波路フィルム内で伝搬するようになっており、導波路フィルムは別の領域（グレーティングが無い領域）に延びており、そこで平面導波路励起を生じさせている。この構成はエバネッセント波（ＥＷ）蛍光発光励起のために最適化されている。なぜなら蛍光発光は導かれた平面導波路モードにより励起されるからである（導波路グレーティングカプラのリーキー（leaky：漏れ易い）モードで励起されるのではない）。上記導かれたモード（ガイドモード）は、リーキーモードよりも長い距離伝搬することができる。さらにバルク蛍光発光は平面導波路部分で最小になる。一方、導波路グレーティングカプラでは、少量の光がリークしてしまい、バルク蛍光発光励起が生じてしまう。尚、ゼプトセン社製チップの導波路部分は、屈折率測定に使用することができない。しかし、上記したようなエバネッセント波励起蛍光発光検出スキームもしくはシステムは、少数のバイオセンサもしくは比較的小さなエリアを有するバイオセンサ基質（基板）に適したものになっている。]
[0103] 本発明の実施例では、エバネッセント波励起蛍光発光エリアとエバネッセント波標識非依存（エリア）の双方のセンシングエリア（即ち、検出エリア）は好ましくは導波路グレーティングカプラ領域内に位置している。]
[0104] ４．無標識エバネッセント波バイオセンサベースの細胞アッセイ
コーニング社の研究者は、刺激に応じた（刺激によって発生する）細胞活性（活動）及び細胞行動（挙動、ビヘイビア）をプロービングするための無標識光バイオセンサ（特にＲＷＧバイオセンサ）を使用したアッセイ（分析法）を開発してきた。このような無標識細胞アッセイはマスリディストリビューション細胞アッセイ技術（ＭＲＣＡＴ：Mass Redistribution Cell Assay Technologies）と称され、シグナリングＧタンパク質結合受容体、受容体チロシンキナーゼ及び多くの他の細胞ターゲットを研究する際に使用されたり、上記のようなターゲットに対して化合物をスクリーニングする際に使用されている。ＭＲＣＡＴは主としてＲＷＧバイオセンサを対象としている。しかし、このようなアッセイは全てのタイプのエバネッセント波ベースのバイオセンサ（ＳＰＲもしくはフォトニック結晶バイオセンサを含む）を用いて実施することができる。]
[0105] ＲＷＧバイオセンサが細胞ベースのアッセイに使用できるかは、刺激に対する表面培養細胞の局所的質量密度（mass density）もしくは分布（distribution）の変化に対するエバネッセント波の感度・感応性による（上記アッセイに使用できるのは、上記感度・感応性があるからである）。このエバネッセント波は導波路フィルム内の結合光により生成される。ＲＷＧバイオセンサを使用するホールセル（細胞全体）センシングの場合、センサの構成は３層システムであると考えてよい。３層とは、基質と、グレーティング構造が埋設された導波路フィルムと、細胞層である。なぜなら、生細胞は大きな寸法（典型的には数十ミクロン）を有し、細胞がＲＷＧバイオセンサの表面に直接培養されるからである（通常、培養密度が高くなるまで培養される）。細胞と表面との相互作用は主に３つのタイプの接触を介して起きる。３つのタイプとは、フォーカルコンタクト（focal contact）、クロース（close）コンタクト及び細胞外基質（ＥＣＭ）コンタクトである。このようなコンタクトにおいて、細胞膜は例えば、数ｎｍ（ナノメートル）から１００ｎｍ（あるいは１０１ｎｍ以上）基質から分離することができる。バイオセンサはエバネッセント波を利用してセンサ表面の（もしくはその近傍の）細胞層のリガンド誘発変化を検出する。実効屈折率におけるリガンド誘発変化（即ち、検出されたシグナル）は、次の式（１）のように、細胞層の底部の屈折率変化に正比例する（一次関数で）。]
[0106] （式１）]
[0107] ここで、Ｓ（Ｃ）は細胞層に対する感度、Δｎcはバイオセンサにより検出された細胞層の局所屈折率のリガンド誘発変化である。後者はセンシングボリューム内の細胞ターゲットもしくは分子アッセンブリ（集合・集合体）の局所的濃度の変化に正比例する。これは細胞の周知の物理的性質（細胞内の所定ボリュームの屈折率は生体分子（主にタンパク質）の濃度によりほぼ決まる）による。これはまた、細胞の光学顕微鏡イメージのコントラストの基礎となる。]
[0108] 従って、検出されたシグナルはセンサ表面から所定距離離れた複数個所で起きている質量再分布（マスリディストリビューション）の合計である。全体の応答に対する各質量分布の寄与度は異なる。これはエバネッセント波が指数関数的に減衰するためである。重み付けされたファクタexp(-zi/ΔZc)を考慮に入れると、センサ表面に垂直に発生する検出シグナルは式（２）により規定される。]
[0109] （式２）]
[0110] ここで、ΔＺｃは細胞層内へのペネトレーション深さ、αは比屈折増加（タンパク質の場合、１００ｍＬ/ｇ毎に約０．００１８）、ｚiはマスリディストリビューションが生ずる距離、ｄは細胞層内のスライスの仮想厚さである。また、細胞層は垂直方向等間隔のスライスに分けられる。]
[0111] 受容体バイオロジを研究するために従来の薬理学的アプローチを使用したところ、リガンドが細胞系に発現した受容体に特異的であるとき、リガンド誘発ＤＭＲシグナルもまた受容体に特異的であり、投与量に依存し、サチュレート（飽和）可能であることが分かった（Fang, Y., et atl, in Anal. Chem., 2005, 77, 5720-5725、Biophys. J., 2006, 91. 1925-1940、FEBSLett., 2005, 579, 6365-6374、J. Pharmacol. Tox. Methods, 2007, 55, 314-322、BMCCell Biol., 2007, e24 (1-12）参照）。多数のＧタンパク質結合受容体（ＧＰＣＲ）リガンドを調べてみたところ、効率（有効性）（ＥＣ50値により測定）は文献に出ている従来の方法を用いて計測した値とほとんど同じであることが分かった。ＤＭＲシグナルは新規で生理学的に関連のある細胞反応であり、統合された細胞反応は受容体活性の下流の多くの細胞事象から構成される（により形成される）。リアルタイムの動態と同じようなものであるので、ＤＭＲシグナルは刺激に対する細胞の振舞い及び活性に関する高度な情報を提供してくれる（特に天然の細胞内において）。]
[0112] ５．複数のＲＷＧバイオセンサからなるアレイの場合のエバネッセント波（ＥＷ）励起蛍光発光
本発明は光バイオセンサ（特にＲＷＧバイオセンサ）のアレイのためにエバネッセント波励起蛍光発光を可能とする方法を提供する。ＲＷＧバイオセンサのアレイは好ましくはマイクロタイタープレート（もしくはマイクロプレート）フォーマットで設けられる。その一例はコーニング社のＥｐｉｃバイオセンサマイクロプレートである。このようなマイクロプレートフォーマットにより、ＥＷ（エバネッセント波）蛍光発光が購入し易いツールとなり、高いスループットによりパラレルな検出及びスクリーニング（検出とスクリーイングをパラレルで行うこと）が可能となる。]
[0113] 本発明の実施例では、ＥＷ蛍光発光とＥＷ無標識検出を同じバイオセンサの同じリーダに統合するシステムと方法が提供される。パラレルで標識依存及び標識非依存計測を行うと、無標識検出にさらなる特殊性（特異性）を与えることができる。]
[0114] Ｅｐｉｃシステムは先端的な（改良された、高度な）高スループット無標識プラットフォームである。導波路グレーティングセンサを直接各ウエルの下に統合すれば、センサを例えば、約８３０ｎｍ波長で且つほぼ垂直な入射角度で動作するような構成にすることができる。このような長波長入射光を使用すると、ＥＷ励起蛍光発光と無標識検出を同時に行うのに適した蛍光発光タグを選択することが困難になる。なぜならこの励起範囲に入る蛍光分子は市場にはほとんど存在しないからである。低い励起波長を有する近赤外線（ＮＩＲ）色素分子は市場入手可能である。その一例は、７９０ｎｍで励起することができるＬＩ−ＣＯＲ社製の近赤外線色素である。しかしながら、これらの励起波長は所望入射角度（例えば、ＲＷＧバイオセンサのアレイを使用する大規模なアッセイの場合（特に細胞ベースで用いる場合）はほぼ垂直な入射角度）における共鳴波長（例えば、約８３０ｎＭ）よりかなり低いので、上記したようなデュアル検出のためには（特に低励起波長の色素を使用するためには）現在のバイオセンサ検出システムを大幅に改良することが望まれる（必要であろう）。]
[0115] 市場入手可能なＥｐｉｃバイオセンサプラットフォーム（コーニング社製）は公称垂直な角度で光を結合するための（ために）長波長（約８３０ｎｍ）をサポートすることができる。しかしながら、多くの市場入手可能な膜電位感応色素は可視波長（例えば、約４００ｎｍ−約６５０ｎｍ）で励起する。よって、本発明の実施例では好ましくは、公称垂直な角度で入射する可視光の結合と共鳴が可能なＲＷＧバイオセンサを使用する。このようなバイオセンサは容易に製造することができる。例えば、センサの構成（ピッチ、グレーティング深さ、導波路厚さ及び導波路材料）を適宜変更・調整することによって製造することができる。]
[0116] 添付図面を参照すると図１には、生細胞（１４０）内のセンサのセンシングボリューム（１４２）内の細胞物質（１４５）のダイナミックな移動の結果として現れるエバネッセント波（１３５）励起蛍光発光（１５０）とエバネッセント波（１３５）生成光シグナル（ＤＭＲシグナル）の両方を同時に検出する共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）バイオセンサの概略が示されている。ＲＷＧバイオセンサ（１１８）は、基質（１２０）と、グレーティング構造を有する導波路薄フィルム（膜）（１２５）と、接触表面（１３０）とを含む。バイオセンサは広範囲の波長からなる入射光（１１０）を使用してバイオセンサを照射する。その結果、特異（特定）波長もしくは角度の光を導波路に結合することができる。この光は上記薄フィルム（薄膜）内を伝搬し、その後、反射される。反射光（１１５）は収集され、記録され、刺激に対する細胞の光シグナルもしくはＤＭＲシグナルについて分析される。エバネッセント波励起蛍光発光は例えば、ＣＣＤカメラを使用して記録することができ、細胞内における時間経過に伴う蛍光分子のリディストリビューションが分析される。デュアル検出スイープ波長光インターロゲーションシステムを使用して、上記した２つのタイプのシグナルを集めることができる。] 図１
[0117] ６．センサ構造及び検出スキームがＲＷＧバイオセンサのアレイを用いたデュアル検出を可能にする
本発明の実施例ではセンサ、検出スキームもしくは両者を強化すると共にＲＷＧバイオセンサのアレイでデュアル検出を可能にする方法が提供される。本発明では、このようなデュアル検出システムのためにＣＣＤカメラベースのスイープ波長インターロゲーションシステムが提供される。このシステムは分光イメージングツールを使用して、一連の異なる波長におけるバイオセンサアレイの共鳴画像を得る。分光画像の各画素はセンサスペクトルを含むので、仮想チャネルとなる（を形成する）。]
[0118] 通常、センサインターロゲーションシステムは４つの主なコンポーネントを含む。即ち、（１）スイープ波長方式でバイオセンサを照射して、アレイ内の各バイオセンサが同時に照射されるようにする調整可能レーザ（但し、共鳴波長はアレイ内のセンサ毎に異なってもよい。レーザは照射光学系を通り、レーザビーム光が拡長されて全センサエリアの一部を照射する）と、（２）レーザ波長を動的に計測するために使用される波長基準（wavelength referencing）インターフェロメータと、（３）デジタル出力を出力できると共に調整可能レーザが波長を走査すると分光イメージを記録することができるエリア走査イメージセンサを有するデジタルカメラと、（４）マルチエレメントレンズによって、前記照射されたセンサエリアをデジタルカメラに結像するイメージング光学系とを含む。]
[0119] 図２Ａ−図２Ｃは、刺激に対して発生する生細胞の標識非依存光シグナルと標識依存蛍光発光シグナルの両方を検出することができるバイオセンサシステムの典型的な構成の概略を示している。図２Ａは、導波路グレーティング結合センサのアレイ（１１８）と、レーザ光源（２１１）と、レーザビームを整形して検出エリアをカバーするように（照射）するコリメータレンズ（２１２）と、プラスマイナス１（＋１）ｎｍの帯域幅を有する励起フィルタ（２１３）と、露光時間を制御してフォトブリーチング（光退色）を最小にする光学シャッタ（２１４）と、励起ビームの偏光をセンサ（１１８）のＴＭもしくはＴＥ方向に整列させる偏光コントローラ（２１５）と、を含む典型的な装置を示している。上記フィルタの入射角を調整することによって、レーザ波長をトラッキングすることができる。この装置はさらに、ビームスプリッタ（２１６）と、結像（投影）レンズ（２１７、２１８）と、ノッチフィルタ及び蛍光発光フィルタ（２１９）と、ＣＣＤカメラ（２２０）とを含むことができる。励起ビームの入射角はビームスプリッタ（２１６）を介して調節できる。] 図２Ａ 図２Ｃ
[0120] 図２Ｂは、導波路グレーティングカプラセンサのアレイ（１１８）と、レーザ光源（２１１）と、レーザビームを整形して検出エリアをカバーするように（照射）するコリメータレンズ（２１２）と、プラスマイナス１（＋１）ｎｍの帯域幅を有する励起フィルタ（２１３）と、露光時間を制御してフォトブリーチング（光退色）を最小にする光学シャッタ（２１４）と、励起ビームの偏光をセンサ（１１８）のＴＭもしくはＴＥ方向に整列させる偏光コントローラ（２１５）と、を含む典型的な装置を示している。上記フィルタの入射角を調整することによって、レーザ波長をトラッキングすることができる。この装置はさらに、ビームスプリッタ（２１６）と、結像（投影）レンズ（２１７、２１８）と、ノッチフィルタ及び蛍光発光フィルタ（２１９）と、ＣＣＤカメラ（２２０）とを含むことができる。励起ビームの入射角はビームスプリッタ（２１６）を介して調節できる。さらに、この装置は、ファイバ接続調整可能レーザ（２３２）と、コリメータレンズ（２３１）と、ビームスプリッタ（２３０）を含むことができる。調整可能なレーザは、スイープ波長イメージング光インターロゲーションシステムに使用する。ここで使用される検出光学系（２１７、２１８、２１９）及びカメラ（２２０）は無標識イメージング及びＥＷ蛍光発光イメージングに共用される。２つの検出モードは例えば約１秒以内でスイッチ可能である（あるいは交代可能である）。この実施例では蛍光発光シグナルを使用してセンサをインターロゲートすることができる。蛍光発光強度の角度スペクトラムもしくは波長スペクトラムを使用して、ピーク蛍光発光及び屈折率を同時に得ることができる。] 図２Ｂ
[0121] 図２Ｃは本発明の他のシステム及び装置を示している。このシステム及び装置は、導波路グレーティング結合センサのアレイ（１１８）と、レーザ光源（２１１）と、レーザビームを整形して検出エリアをカバーするように（照射）するコリメータレンズ（２１２）と、プラスマイナス１（＋１）ｎｍの帯域幅を有する励起フィルタ（２１３）と、露光時間を制御してフォトブリーチング（光退色）を最小にする光学シャッタ（２１４）と、励起ビームの偏光をセンサ（１１８）のＴＭもしくはＴＥ方向に整列させる偏光コントローラ（２１５）とを含む。上記フィルタの入射角を調整することによって、レーザ波長をトラッキングすることができる。この装置はさらに、ビームスプリッタ（２１６）と、結像（投影）レンズ（２１７、２１８）と、ノッチフィルタ及び蛍光発光フィルタ（２１９）と、ＣＣＤカメラ（２２０）とを含むことができる。励起ビームの入射角はビームスプリッタ（２１６）を介して調節できる。さらに、この装置は、ファイバ接続調整可能レーザ（２３２）と、コリメータレンズ（２３１）と、ビームスプリッタ（２３０）と、ダイクロイックミラーもしくはダイクロマティックビームスプリッタ（２３５）と、後端レンズ（２４１）と、ＣＣＤ／ＣＭＯＳカメラ（２４２）とを含むことができる。調整可能なレーザは、スイープ波長イメージング光学インターロゲーションシステムに使用することができる。ここで使用される検出光学系及びカメラはＥＷ蛍光発光イメージングから分離することができる。２つの検出モードは同時に且つパラレルに動作可能である。] 図２Ｃ
[0122] ６．１センサモデリング
グレーティングカプラのフェーズマッチング条件は式（３）のように表わすことができる。]
[0123] （式３）]
[0124] ここで、ｎは導波路の有効（実効）屈折率、θは入射角、ｍは回折次数、λは波長、Λはグレーティングピッチである。プラス（＋）はフォワード伝搬モードへの結合に対応し、マイナス（−）はリバース伝搬モードに対応する。Ｅｐｉｃセンサは約８２７ｎｍの垂直入射共鳴波長を有することができる。スイープ波長インターロゲーションシステムで使用される調整可能レーザの中心波長は、例えば米国特許出願１１／７１１２０７号（出願日２００７年２月２７日、発明の名称「Swept Wavelength Imaging Optical Interrogation System and Method for Using Same」）に記載されているように、８４２ｎｍである。レーザは約３度の入射角においてリバース伝搬導波路モードに結合される。]
[0125] 式（３）に基づけば、センサの共鳴波長は、適切な入射角でフォワード伝搬導波路モードに結合されたときは短い波長の方にシフトすることができる。フォワード伝搬モードで短い波長の方へ動くと、導波路はシングルモードではなくなる。このことにより、グレーティング回折効率が減少する可能性がある。結合波分析（ＲＣＷＡ）方法を使用すると（リファレンス１４及び１５）、現在のコーニング社のＥｐｉｃバイオセンサの構成についての数値シミュレーションの結果として、入射角と共鳴波長の間には相関関係があることが示唆される（使用されるモードに依存する）。コーニング社のＥｐｉｃバイオセンサは、厚さ約１５０ｎｍでグレーティングピッチ約５００ｎｍでグレーティング深さ約５０ｎｍのＮｂ2Ｏ5導波路薄膜を有することができる。]
[0126] トランスバースマグネティック（ＴＭ：transverse magnetic）モードの場合、リバース伝搬ＴＭモードで入射角が３．２３度であるならば、共鳴波長は８４０ｎｍにシフトされる。共鳴の幅は導波路グレーティングカプラのリーク係数に関連している。共鳴が狭くなればなるほど、結合距離は長くなる。これは通常、Ｅｐｉｃセンサの場合、約２００ミクロンである。対称的に、フォワード伝搬ＴＭモードが使用される場合、入射角が増加すると共鳴波長は左にシフトする。しかしながら、グレーティング共鳴反射率は約７８８ｎｍで急に落ち始める。即ち、波長を数ナノメートル調整すると、グレーティング結合効率に大きな違いが現れる。さらに、フォワード伝搬モードの共鳴幅はリバース伝搬モードの共鳴幅の約１／３である。この効果は必要であればさらなるＥＷ蛍光発光強化に利用することができる。]
[0127] ＴＥモード励起の場合、ＴＥ共鳴は、波長が５８０ｎｍに減少するまで（入射角が５３度のところ）ほぼ１００％回折率で維持することができる。ＴＥ共鳴はかなり低い波長まで効率的な結合を維持することができるが、共鳴幅はＴＭモードの場合と比べ約２０倍広くなる。]
[0128] 図３は共鳴波長と入射角の相関関係を示している（トランスバースマグネティック（ＴＭ）モード使用）。図３Ａはコーニング社のＥｐｉｃバイオセンサアレイもしくはマイクロプレートの場合の結果を示しており、入射角が３．２３度のときリバース伝搬ＴＭモードの共鳴波長は８４０ｎｍである。図３Ｂは、フォワード伝搬モードが励起されたときの共鳴波長と入射角の逆の関係（逆相関）を示している。入射角が大きくなると（例えば、約３．４度から約０．１度ずつ増加すると（右からスタート））、共鳴波長は小さくなる。]
[0129] 図４は共鳴波長と入射角の相関関係を示している（トランスバースエレクトリック（ＴＥ）モード使用）。図４Ａはコーニング社のＥｐｉｃバイオセンサアレイもしくはマイクロプレートの場合の結果を示しており、入射角が１６度から１７度へさらに１８度へと大きくなるとフォワード伝搬ＴＥモードの共鳴波長が小さくなっている。これは、適切な入射角を使用するＴＥフォワード伝搬モードは、７８５ｎｍの蛍光発光を励起するのに使用出来ることを示している。図４Ｂは、入射角が右側から３５度から１度ずつ増加すると、ＴＥモード共鳴が、１００％回折効率でかなり広い波長ウインドウをカバーしていることを示している。]
[0130] ６．２近赤外線ＥＷ励起蛍光発光の場合のセンサ最適化
導波路グレーティング結合（カップリング）の共鳴強化は式（４）で得られるＱファクタ（因子）を用いて理解することができる。]
[0131] （式４）]
[0132] ここで、λ0は共鳴波長、Δλは共鳴スペクトラムの最大半量における全幅である。光共鳴器の場合と同様に、Ｑファクタが大きいほど、光子寿命が長くなり、キャビティ内電場（電界）が強くなる。蛍光発光強化はＱファクタとエバネッセント場の強度に比例する。よって、ＴＥモード励起の強化は、漏れ係数が大きいために、ＴＭモードの場合よりも少なくとも２０ファクタ小さい。]
[0133] 本発明は、最適なデュアル検出のために導波路グレーティングバイオセンサの構成を強化（機能強化）・改善する方法を提供する。実施例ではグレーティングピッチを減ずることによって、共鳴波長を効率的に短い波長へシフトすることができる。実施例では、同じグレーティングを維持し且つ導波路厚さを減ずることによって、共鳴を低い方へ（但し、その量は少なく）シフトすることができる。導波路厚さが１４６ｎｍから１００ｎｍへ減じられると、リバース電波ＴＭモードの共鳴波長は７８５ｎｍになる。導波路厚さを更に減ずると、ガイディング（guiding）が弱くなりエバネッセント場も小さくなる。フォワード伝搬モードはリバース伝搬モードより狭い共鳴を有する。センサの構成は最大エバネッセント場感度を得るようにすることができ、その結果、フォワード伝搬ＴＭモードを使用し且つセンサを変えないで最大の蛍光発光強化を達成することができる。]
[0134] ６．３可視波長ＥＷ励起蛍光発光の場合のセンサ最適化
本発明の実施例では、可視励起波長で色素分子（もしくはそのコンジュゲート（conjugate：抱合体、接合体、複合物））のＥＷ励起蛍光発光を可能にする方法が提供される。この方法は入射角依存共鳴波長を利用して共鳴波長を強化し、そのことによりデュアル検出システム及び方法が実施可能になる。実施例ではＴＥモードを使用して、短い波長の色素を励起する（但し、２０倍低い強化で）。実施例ではＴＭモードをフォワード伝搬導波路モードで使用し、短い波長の色素を励起する（この場合、大きな入射角で）。大きな入射角においてＴＭモードのモデリングをしたところ、共鳴波長が８４０ｎｍから可視波長へ減少すると、回折グレーティング効率はまず低下し、その後、増加することがわかった。低い共鳴波長における回折効率は約４０％と約７０％の間であるが、共鳴幅が狭い。このことは表面蛍光発光強化がＴＥモード励起の場合よりも１桁大きい強度であることを示唆している。実施例では２次回折を使用して、さらに短い波長の光を結合することができる。理論によって限定・特定されてはいないが、かなり大きな強化が４００ｎｍ領域において予想される。]
[0135] 図５は、入射角が１度から５７度へ増加したときの（右から左へ１度ずつ増加）ＴＭモードのグレーティング反射率スペクトラを示している。より大きい入射角でＴＭモードのモデリングをしたところ、波長が約７５０ｎｍより短くなると回折グレーティング効率が増加し始めることが分かった。回折効率は例えば約４０％から約７０％であるが、共鳴幅が狭いということは、表面蛍光発光強化がＴＭモード励起よりも約１桁強いことを示唆している。] 図５
[0136] 図６Ａ及び図６Ｂは短い波長の光が２次回折を介してグレーティングに共鳴結合され得ることを示している。図６Ａは２次回折ＴＥモードが使用された場合の予想される共鳴周波数を示している（入射角は３３度で右から２度ずつ増加）。図６Ｂは２次回折ＴＭモードが使用された場合の予想される共鳴周波数を示している（入射角は４１度で右から２度ずつ増加）。]
[0137] ７．生細胞内の細胞シグナリングのデュアル検出
本発明の実施例では、刺激に応じて生細胞内で発生するＥＷベースの無標識シグナル（ＤＭＲシグナル）とＥＷ励起蛍光発光シグナルのデュアル検出を可能にする方法が提供される。本発明は１つのセンサから２つの検出ができるようにするために、１つの共鳴波長を強化する（利用価値を上げる）方法を提供する。固定化細胞を有する同じ（１つの）バイオセンサからこのようなパラレル検出ができると、刺激に対する細胞シグナリングもしくは活性化を検出することができ、高度な情報内容を提供することができる。標識を有する特異（特定の）ターゲットのＥＷ励起蛍光発光を計測することによって、当該ターゲットと無標識光シグナル（ＤＭＲシグナル）の間の相関関係を確立することができる。図１２に示されているように、ＮＩＲ（近赤外線）色素標識化ＥＧＦを使用すると、ＥＷ励起蛍光発光を用いて、細胞層の基底膜表面に位置するＥＧＦＲへの標識化ＥＧＦの結合を計測することができる。また、その後、結合された標識化ＥＧＦと活性化受容体の内部移行（インターナリゼーション）を計測することができる。並行して、標識化ＥＧＦにより誘発されたＡ４３１細胞のＥＷ生成光応答（即ち、ＤＭＲシグナル）を記録することができる。その結果を見ると、標識化ＥＧＦがＤＭＲシグナルを引き起こしていることが分かる（これは無標識化ＥＧＦによって引き起こされたシグナルと同様である）（Fang, Y., et al., Biophys. J., 2006, 91, 1925-1940（データは示されず））。またＤＭＲシグナルは２つのフェーズからなる。１つのフェーズは最初の増加シグナル（Ｐ−ＤＭＲ）で、もう１つのフェーズはその後の減少シグナル（Ｎ−ＤＭＲ）である。]
[0138] ８．イオンチャネル活性をモニタするための標識依存及び標識非依存細胞アッセイ
本発明の実施例では、光バイオセンサ（特に複数の光バイオセンサ）と標識依存及び標識非依存計測の組み合わせに基づく方法とを使用して、生細胞中のイオンチャネル活性を計測するシステム及び方法が提供される。より詳しくは、固定化生細胞を有するバイオセンサは、イオンチャネル活性に対する細胞反応（例えば、ダイナミックマスリディストリビューション）を標識非依存形式で計測することができ、同時に、膜電位感応標識もしくは物質（例えば、膜電位感応色素分子）のリディストリビューションによるエバネッセント波励起蛍光発光の変化を計測することができる。]
[0139] 実施例では、株化細胞培養方法及び培養密度を使用して、生細胞をバイオセンサ表面（１３３０）（図１３、図１４及び図１５）に固定化することもしくはこれの近傍に位置させることができる。バイオセンサは例えば、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）バイオセンサ、共鳴導波路グレーティング（ＲＷＧ）バイオセンサ、フォトニック結晶バイオセンサ、共鳴ミラー等、もしくはこれらの組み合わせである。ＲＷＧバイオセンサは例えば、埋設周期グレーティング構造（例えば、図１３Ａの符号１３４０）を有する導波路薄膜を含む。この構造は基板（例えば、ガラス、プラスチック等）（例えば、図１３Ａの符号１３５０）に溶着されている。]
[0140] 図１３Ａ−図１３Ｃは、本発明のバイオセンサシステム及び方法を示している。このシステム及び方法は、基底細胞膜表面における可視領域内でび膜電位感応色素を励起する。その結果、イオンチャネル開口誘発細胞脱分極により、エバネッセント波励起蛍光発光が減少する。図１３Ａは可視波長蛍光発光色素（１３２０）を有するイオンチャネル（１３００）を備える生細胞の基底膜（１３１０）を示している。この色素は膜電位に感応する。膜電位は負の静止電位状態にある場合がある。負の静止電位状態では帯電脂質分子の分布が非対称であるので、色素分子の多くは基底膜二重層の外側リーフレット（leaflet）に位置する。イオンチャネルが物理的もしくは化学的手段（例えば、機械的な力、電圧、リガンドその他のもの）によりオープンした後、細胞は脱分極する。図１３Ｂに示されるように、脱分極の結果、脂質膜二重層の外側リーフレットに位置する膜電位感応色素分子は内側リーフレットに移動し、蛍光発光位置（センサ表面から例えば約３ｎｍ−約５ｎｍ離れたところ）に至る。仮想例では、細胞形態的変化と相俟って、膜電位感応色素分子のこのような移動は蛍光発光強度の低下を引き起こす場合がある。これは、超高感度エバネッセント波励起蛍光発光計測により顕在化し検出することができる。図１３Ｃはこの脱分極のために、時間経過と共に減少する蛍光発光シグナル強度の予想を示している。]
[0141] 実施例ではバイオセンサ表面の固定化細胞に、一対の蛍光分子（例えば、膜電位感応色素等と、膜電位変化に感応する蛍光脂質）をプレロードすることができる。これら蛍光分子はいずれも、励起スペクトラムの少なくとも可視領域において感応する。図１４Ａ−図１４Ｃは一対の蛍光色素を励起するバイオセンサシステム及び方法を示している。一対の蛍光色素のうちの１つは基底細胞膜表面において可視領域にある膜電位感応色素である。これは、イオンチャネル開口誘発細胞脱分極により、エバネッセント波励起蛍光発光を減少させる。イオンチャネル（１４００）を有する細胞の基底膜（１４１０）には、一対の蛍光色素をプレロードすることができる。例えば、エネルギードナー物質（例えば、クマリンリンク（coumarin-linked）リン脂質（ＣＣ２−ＤＭＰＥ）（１４３０））は、細胞膜の外側リーフレットに挿入することができ、比較的定常な状態を維持するか比較的局所的に存在する状態を維持する。エネルギーアクセプタ物質（１４２０）（例えば、負帯電オキソノール色素ＤｉＳＢＡＣ２）は、膜電位に基づいて膜全体に再分布させたりその分布を変化させたりすることができる。負の静止膜電位において、アクセプタ色素はドナー色素（即ち、基底膜の外側リーフレット）の近傍に位置し、エネルギー伝達が生じ得る。イオンチャネルが物理的もしくは化学的手段（例えば、機械的力、電圧、リガンドその他）によりオープンした後、細胞膜は脱分極する。脱分極に伴う膜電位の変化によってオキソノール色素（例えば、図１４Ｂの符号１４２０）が再分布され、ドナーとアクセプタの間の分離距離が大きくなったために、分子間エネルギー伝達の効率は低下する。これら変化の後にリアルタイムで共鳴光を使用したドナー色素の励起が行われ、アクセプタ色素の発光波長における蛍光発光を計測する。アクセプタ色素の脱分極誘発再分布は蛍光発光の減少を引き起こす（その理由は、ドナー色素からアクセプタへのエネルギー伝達が不足・減少するからである）。ここでセンサを可視波長光で照射することにより、ドナーの蛍光発光を選択的に励起することができる（但し、システムはアクセプタの蛍光発光を計測する）。図１４Ｃは、上記のように当初は対になっていた膜電位感応色素を用いて達成された脱分極の結果として、時間経過と共に減少する蛍光発光シグナル強度の予想を示している。]
[0142] 実施例では、細胞に膜電位感応物質（例えば、色素及び蛍光発光クエンチャー）をプレロードすることができる。図１５Ａ−図１５Ｃは蛍光発光クエンチャが存在した場合の可視領域における膜電位感応色素を励起するバイオセンサシステム及び方法を示している。色素とクエンチャの双方を基底細胞膜表面に位置させると、イオンチャネル開口誘発脱分極によってエバネッセント波励起蛍光発光が増加する。図１５Ａはイオンチャネル（１５００）を有する細胞の基底膜（１５１０）を示している。これには、リン脂質変性（modified）蛍光発光クエンチャ（１５３０）（例えば、ナノゴールドリン脂質コンジュゲート）と膜電位感応蛍光色素（１５２０）（例えば、負帯電オキソノール色素ＤｉＳＢＡＣ２）がプレロードされている。膜電位感応色素（１５２０）は膜電位に基づいて当該膜全体における分布を変えることができる。クエンチャ（１５３０）は、近傍にあると、蛍光色素を消光（失活させる）することができる。負静止膜電位の場合、色素はクエンチャ（つまり、基底膜の外側リーフレット）の近傍にあり、蛍光発光クエンチング（消光）が生じ得る。イオンチャネルが物理的もしくは化学的手段（例えば、機械的な力、電圧、リガンド等）によりオープン（開口）された後、細胞は脱分極する。図１５Ｂは電位感応色素を再分布させる脱分極の結果として得られる膜電位の変化を示している。色素とクエンチャの間の距離が大きくなるので、クエンチャは蛍光発光を消光（失活）することができない。その結果、エバネッセント波励起蛍光発光が増加する。図１５Ｃは当初対になっていた膜電位感応色素及びクエンチャ脂質により脱分極が生じた場合の蛍光発光シグナル強度の増加予想を時間と共に示している。]

权利要求:

請求項1
エバネッセント波無標識光とエバネッセント励起蛍光発光を検出するためのシステムであって、光学センサと、前記センサを照射する光源と、前記センサから発っせられる前記エバネッセント波無標識光とエバネッセント波励起蛍光発光を集める光学検出器と、前記集められた光を分析するプロセッサと、を含むことを特徴とするシステム。
請求項2
前記光学センサはマイクロプレートに設けられた導波路グレーティング結合センサのアレイからなる請求項１記載のシステム。
請求項3
前記光学センサは当該センサの表面に固定化された少なくとも１つの生細胞を有する請求項１記載のシステム。
請求項4
前記光源は約４００ナノメートルから約９００ナノメートルの波長を有するファイバ結合調整可能レーザシステムからなる請求項１記載のシステム。
請求項5
前記光学検出器は自己参照型の干渉計を含む請求項１記載のシステム。
請求項6
前記光学検出器は、前記光源のビームの入射角を調節する第１ビームスプリッタと、エバネッセント波無標識反射光とエバネッセント波励起蛍光標識発光を選択する第２ビームスプリッタとを含む請求項１記載のシステム。
請求項7
前記光学検出器は、エバネッセント波無標識反射光を集める第１デジタルカメラと、エバネッセント波励起蛍光標識発光を集める第２デジタルカメラとを含む請求項１記載のシステム。
請求項8
前記光学検出器は、コリメータレンズ、プラスマイナス１ｎｍの帯域幅を有することができる励起フィルタ、光学シャッタ、偏光制御装置、イメージングレンズ、ノッチフィルタ、蛍光発光フィルタの少なくとも１つを含むか、これらの組み合わせを含む請求項１記載のシステム。
請求項9
生細胞を特徴付ける方法であって、センサ表面に固定化された生細胞を有する請求項１のシステムを準備するステップと、前記固定化細胞を第１蛍光標識化刺激に接触させるステップと、エバネッセント波無標識光とエバネッセント波励起蛍光標識発光について前記センサをインターロゲートすることによって、選択された細胞ターゲットに対する前記第１蛍光標識化刺激接触の影響を検出するステップと、前記センサのエバネッセント波無標識光とエバネッセント波励起蛍光標識発光を第２刺激が存在する状態としない状態で比較するステップと、を含む方法。
請求項10
前記蛍光標識化刺激は前記センサ表面に固定化された生細胞に付随する少なくとも１つのターゲットに対する結合力を有する請求項９記載の方法。
請求項11
前記センサをインターロゲートするステップは、前記センサの表面の固定化生細胞の基底細胞膜表面との関連性を有する蛍光標識刺激を励起する請求項９記載の方法。
請求項12
前記センサをインターロゲートするステップは、前記固定化生細胞のダイナミックマスリディストリビューション事象に付随するエバネッセント波無標識光を提供する請求項９記載の方法。
請求項13
前記エバネッセント波蛍光発光及びエバネッセント波無標識光について前記センサをインターロゲートするステップは、順次に、同時に、もしくはそれらの組み合わせで行われる請求項９記載の方法。
請求項14
前記センサは、共鳴導波路グレーティングバイオセンサ、表面プラズモン共鳴、フォトニック結晶バイオセンサ若しくは共鳴ミラーである請求項９記載の方法。
請求項15
生細胞を特徴付ける方法であって、センサ表面に固定化され蛍光発光ターゲットを有する生細胞を備える請求項１のシステムを準備するステップと、前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、エバネッセント波蛍光発光について前記センサをインターロゲートすることによって、蛍光発光ターゲットにおける刺激誘発変化を検出するステップと、エバネッセント波無標識光における刺激誘発変化を検出するステップと、を含む方法。
請求項16
蛍光発光ターゲットを有する生細胞は、蛍光タンパク質を発現する遺伝子発現ベクターにより得られる請求項１５記載の方法。
請求項17
蛍光発光ターゲットを有する生細胞は、形質移入（トランスフェクション）、細胞表面膜への脂質ターゲットの挿入、もしくはこれらの組み合わせにより得られる請求項１６記載の方法。
請求項18
エバネッセント波無標識光とエバネッセント励起蛍光発光を検出するためのデュアル検出システムであって、光学センサと、前記センサを照射する光源と、前記センサから前記エバネッセント波無標識光を集める第１光学検出器と、前記センサから前記エバネッセント波励起蛍光発光を集める第２光学検出器と、前記集められた光を分析するプロセッサと、を含むことを特徴とするデュアル検出システム。
請求項19
前記光学センサは、所定パターンを有する基準領域、生細胞もしくは生体分子を有するサンプル領域、またはこれらの組み合わせを備える請求項１８記載のデュアル検出システム。
請求項20
１つのセンサからのエバネッセント波無標識シグナルとエバネッセント励起蛍光シグナルの１つの共鳴波長の検出を強化する方法であって、蛍光標識を有する特定のターゲットの前記エバネッセント波励起蛍光シグナルを計測すると共に、刺激が与えられた場合の無標識ダイナミンマスリディストリビューションシグナルを計測するステップと、前記ターゲットからの計測された蛍光シグナルと前記無標識ダイナミックマスリディストリビューションシグナルを相関させるステップと、を含む方法。
請求項21
前記蛍光シグナルと前記無標識ダイナミックマスリディストリビューションシグナルを相関させるステップは、前記２つのシグナルの動態プロファイルを比較するステップと、シグナリングカスケードを変えることによって得られる前記２つのシグナルの調節プロファイルを比較するステップと、細胞反応に対する遺伝子変更の影響を比較するステップと、の少なくとも１つのステップを含むか、上記ステップの組み合わせを含む請求項２０記載の方法。
請求項22
生細胞内のイオンチャネル活性をデュアル検出する方法であって、バイオセンサ表面に固定化された少なくとも１つの生細胞を有するバイオセンサを準備するステップと、前記固定化細胞に膜電位感応色素を付けるステップと、前記膜電位感応色素を有する前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、刺激誘発光学無標識シグナルとエバネッセント波励起蛍光シグナルを検出するステップと、を含むことを特徴とする方法。
請求項23
生細胞内のイオンチャネル活性をデュアル検出する方法であって、バイオセンサ表面に固定化された少なくとも１つの生細胞を有するバイオセンサを準備するステップと、前記固定化細胞に膜電位感応色素及び蛍光脂質を付けるステップと、前記色素及び脂質を有する前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、刺激誘発光学無標識シグナルとエバネッセント波励起蛍光シグナルを検出するステップと、を含み、前記蛍光シグナルは前記色素と脂質の間の蛍光共鳴エネルギ伝達の変化に伴い変化することを特徴とする方法。
請求項24
生細胞内のイオンチャネル活性をデュアル検出する方法であって、バイオセンサ表面に固定化された少なくとも１つの生細胞を有するバイオセンサを準備するステップと、前記固定化細胞に膜電位感応色素及びクエンチャ脂質を付けるステップと、前記色素及びクエンチャ脂質を有する前記固定化細胞を刺激に接触させるステップと、刺激誘発光学無標識シグナルとエバネッセント波励起蛍光シグナルを検出するステップと、を含み、前記検出された蛍光シグナルは前記クエンチャ脂質と膜電位感応色素の間の距離の変化に伴い変化することを特徴とする方法。